Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNA8P32881 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNA8P32881 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IFNA8P32881 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFNA8P32881 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IFNA8P32881 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IFNA8P32881 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms