Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IFNA8P32881 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
IFNA8P32881 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
IFNA8P32881 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
IFNA8P32881 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IFNA8P32881 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
IFNA8P32881 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IFNA8P32881 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFNA8P32881 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
IFNA8P32881 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
IFNA8P32881 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IFNA8P32881 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IFNA8P32881 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
IFNA8P32881 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IFNA8P32881 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFNA8P32881 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFNA8P32881 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IFNA8P32881 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFNA8P32881 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFNA8P32881 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFNA8P32881 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFNA8P32881 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFNA8P32881 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFNA8P32881 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IFNA8P32881 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IFNA8P32881 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IFNA8P32881 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNA8P32881 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFNA8P32881 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFNA8P32881 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFNA8P32881 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IFNA8P32881 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFNA8P32881 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFNA8P32881 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNA8P32881 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFNA8P32881 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFNA8P32881 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFNA8P32881 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFNA8P32881 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFNA8P32881 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFNA8P32881 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFNA8P32881 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNA8P32881 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFNA8P32881 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNA8P32881 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFNA8P32881 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFNA8P32881 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFNA8P32881 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFNA8P32881 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNA8P32881 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFNA8P32881 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IFNA8P32881 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFNA8P32881 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFNA8P32881 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFNA8P32881 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFNA8P32881 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IFNA8P32881 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFNA8P32881 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFNA8P32881 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFNA8P32881 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFNA8P32881 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFNA8P32881 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFNA8P32881 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IFNA8P32881 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IFNA8P32881 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNA8P32881 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IFNA8P32881 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IFNA8P32881 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFNA8P32881 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFNA8P32881 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFNA8P32881 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFNA8P32881 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IFNA8P32881 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IFNA8P32881 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IFNA8P32881 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IFNA8P32881 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IFNA8P32881 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNA8P32881 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IFNA8P32881 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNA8P32881 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNA8P32881 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IFNA8P32881 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IFNA8P32881 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IFNA8P32881 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IFNA8P32881 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNA8P32881 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IFNA8P32881 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNA8P32881 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IFNA8P32881 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IFNA8P32881 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IFNA8P32881 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IFNA8P32881 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IFNA8P32881 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
IFNA8P32881 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFNA8P32881 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IFNA8P32881 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFNA8P32881 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
IFNA8P32881 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFNA8P32881 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFNA8P32881 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms