Protein–RNA interactions for Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 PPA1-203ENST00000460755 412 ntTSL 53.34□□□□□ -1.872e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.892e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 CUL3-206ENST00000436172 576 ntTSL 43.19□□□□□ -1.92e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 PPA1-204ENST00000495346 282 ntTSL 32.98□□□□□ -1.932e-9■■■■■ 39
XRCC6P12956 RN7SKP90-201ENST00000363013 335 ntBASIC14.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 38.9
XRCC6P12956 NUP214-207ENST00000476004 502 ntTSL 316.61■□□□□ 0.251e-15■■■■■ 38.7
XRCC6P12956 NUP214-211ENST00000498010 483 ntTSL 514□□□□□ -0.171e-15■■■■■ 38.7
XRCC6P12956 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 512.74□□□□□ -0.371e-15■■■■■ 38.7
XRCC6P12956 NUP214-208ENST00000483497 3275 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.91e-15■■■■■ 38.7
XRCC6P12956 NUP214-221ENST00000530491 502 ntTSL 36.76□□□□□ -1.331e-15■■■■■ 38.7
XRCC6P12956 TNRC6A-209ENST00000562829 277 ntTSL 218.63■□□□□ 0.576e-8■■■■■ 38.4
XRCC6P12956 TNRC6A-211ENST00000566108 454 ntTSL 314.37□□□□□ -0.116e-8■■■■■ 38.4
XRCC6P12956 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.39□□□□□ -2.031e-323■■■■■ 38.4
XRCC6P12956 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.562e-32■■■■■ 38.3
XRCC6P12956 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-32■■■■■ 38.3
XRCC6P12956 SEMA4B-206ENST00000558895 533 ntTSL 427.46■■□□□ 1.998e-7■■■■■ 38
XRCC6P12956 SEMA4B-218ENST00000561085 582 ntTSL 425.74■■□□□ 1.718e-7■■■■■ 38
XRCC6P12956 SEMA4B-215ENST00000560089 2804 ntTSL 1 (best)24.85■■□□□ 1.578e-7■■■■■ 38
XRCC6P12956 SEMA4B-212ENST00000559792 585 ntTSL 423.73■■□□□ 1.398e-7■■■■■ 38
XRCC6P12956 SEMA4B-211ENST00000559322 559 ntTSL 421.14■□□□□ 0.978e-7■■■■■ 38
XRCC6P12956 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.888e-7■■■■■ 38
XRCC6P12956 SEMA4B-210ENST00000559300 541 ntTSL 420.3■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 38
XRCC6P12956 SEMA4B-203ENST00000558051 552 ntTSL 418.71■□□□□ 0.598e-7■■■■■ 38
XRCC6P12956 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.498e-7■■■■■ 38
XRCC6P12956 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.062e-12■■■■■ 38
XRCC6P12956 H2AFZ-202ENST00000511203 1880 ntTSL 233.9■■■■□ 3.024e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 H2AFZ-203ENST00000511319 1254 ntTSL 1 (best)32.36■■■□□ 2.774e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.14e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 321.32■■□□□ 14e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.994e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.574e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 DIABLO-215ENST00000541656 732 ntTSL 318.47■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 H2AFZ-204ENST00000511348 1843 ntTSL 1 (best)16.46■□□□□ 0.234e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 DIABLO-202ENST00000342392 1336 ntTSL 1 (best)14.97□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 DIABLO-214ENST00000541273 555 ntTSL 214.25□□□□□ -0.134e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 AC048338.1-201ENST00000535844 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 ABCA13-201ENST00000411975 4480 ntTSL 213.95□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 H2AFZ-205ENST00000527366 435 ntTSL 313.49□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 ABCA13-205ENST00000453246 4275 ntTSL 211.91□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 H2AFZ-206ENST00000529158 726 ntTSL 311.03□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 DIABLO-213ENST00000540535 703 ntTSL 39.32□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 ABCA13-207ENST00000544596 7870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 CENPJ-201ENST00000381884 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.984e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 VPS13D-211ENST00000543710 5676 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 DIABLO-207ENST00000446652 573 ntTSL 36.72□□□□□ -1.334e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 CENPJ-202ENST00000418179 691 ntTSL 1 (best)5.94□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.54e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.664e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 DIABLO-211ENST00000485724 560 ntTSL 24.17□□□□□ -1.744e-7■■■■■ 37.7
XRCC6P12956 AL591806.3-202ENST00000470694 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 221.48■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 37.6
XRCC6P12956 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.753e-6■■■■■ 37.6
XRCC6P12956 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.653e-6■■■■■ 37.6
XRCC6P12956 F11R-201ENST00000335772 571 ntTSL 416.78■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 37.6
XRCC6P12956 F11R-205ENST00000602966 558 ntTSL 416.78■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 37.6
XRCC6P12956 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 37.6
XRCC6P12956 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 37.6
XRCC6P12956 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.415e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-213ENST00000456693 750 ntTSL 522.57■■□□□ 1.25e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.985e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-210ENST00000448708 549 ntTSL 520.85■□□□□ 0.935e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-224ENST00000496396 944 ntTSL 1 (best)20.77■□□□□ 0.925e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-206ENST00000434366 519 ntTSL 520.13■□□□□ 0.815e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-219ENST00000491126 604 ntTSL 419.89■□□□□ 0.775e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-205ENST00000414843 575 ntTSL 419.89■□□□□ 0.775e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-209ENST00000445474 575 ntTSL 419.87■□□□□ 0.775e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-217ENST00000483743 541 ntTSL 519.79■□□□□ 0.765e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-212ENST00000456171 1793 ntTSL 218.53■□□□□ 0.565e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-208ENST00000444537 737 ntTSL 518.03■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-207ENST00000439313 565 ntTSL 516.93■□□□□ 0.35e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.265e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-202ENST00000375458 9367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.145e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-204ENST00000409184 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.92□□□□□ -0.55e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 SKI-204ENST00000508416 252 ntTSL 311.8□□□□□ -0.525e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.745e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 COBLL1-203ENST00000392717 9523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.855e-9■■■■■ 37.3
XRCC6P12956 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.21□□□□□ -2.386e-8■■■■■ 36.8
XRCC6P12956 SREBF2-208ENST00000491541 4043 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.33e-7■■■■■ 36.5
XRCC6P12956 RNA5SP444-201ENST00000516844 106 ntBASIC11.51□□□□□ -0.578e-7■■■■■ 35.7
XRCC6P12956 ZEB1-214ENST00000558863 1355 ntTSL 527.3■■□□□ 1.961e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.331e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.441e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 ZEB1-218ENST00000560196 1014 ntTSL 1 (best)16.46■□□□□ 0.231e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 CNNM3-205ENST00000494595 400 ntTSL 515.79■□□□□ 0.121e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 CNNM3-203ENST00000465224 2607 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.41e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 ZEB1-206ENST00000488625 6026 ntTSL 1 (best)11.79□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 ZEB1-222ENST00000561212 1500 ntTSL 58.78□□□□□ -11e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 ZEB1-217ENST00000559858 2745 ntTSL 1 (best)8.61□□□□□ -1.031e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 ZEB1-216ENST00000559496 1381 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.071e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 ZEB1-223ENST00000561304 1383 ntTSL 1 (best)8.2□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 ZEB1-203ENST00000424869 887 ntTSL 58.19□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 ZEB1-210ENST00000557827 877 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 ZEB1-204ENST00000437844 6246 ntTSL 1 (best)7.36□□□□□ -1.231e-8■■■■■ 35.6
XRCC6P12956 ZEB1-221ENST00000561061 970 ntTSL 1 (best)7.3□□□□□ -1.241e-8■■■■■ 35.6
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