RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559792.5

SEMA4B-212, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 585 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-212ENST00000559792 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.01■■■■■ 6.24
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SEMA4B-212ENST00000559792 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.58■■■■■ 5.37
SEMA4B-212ENST00000559792 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.27■■■■■ 5
SEMA4B-212ENST00000559792 NACADO15069 1562 aa45.88■■■■■ 4.93
SEMA4B-212ENST00000559792 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.76■■■■■ 4.92
SEMA4B-212ENST00000559792 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.68■■■■■ 4.9
SEMA4B-212ENST00000559792 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.4■■■■■ 4.86
SEMA4B-212ENST00000559792 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.31■■■■■ 4.84
SEMA4B-212ENST00000559792 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.09■■■■■ 4.81
SEMA4B-212ENST00000559792 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.93■■■■■ 4.78
SEMA4B-212ENST00000559792 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
SEMA4B-212ENST00000559792 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.52■■■■■ 4.72
SEMA4B-212ENST00000559792 SCRIBQ14160 1630 aa44.36■■■■■ 4.69
SEMA4B-212ENST00000559792 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.16■■■■■ 4.66
SEMA4B-212ENST00000559792 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44■■■■■ 4.63
SEMA4B-212ENST00000559792 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.84■■■■■ 4.61
SEMA4B-212ENST00000559792 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.83■■■■■ 4.61
SEMA4B-212ENST00000559792 NCAPD3P42695 1498 aa42.29■■■■■ 4.36
SEMA4B-212ENST00000559792 SMARCA4P51532 1647 aa42.23■■■■■ 4.35
SEMA4B-212ENST00000559792 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.21■■■■■ 4.35
SEMA4B-212ENST00000559792 SMARCA2P51531 1590 aa42.11■■■■■ 4.33
SEMA4B-212ENST00000559792 ERCC6Q03468 1493 aa42.06■■■■■ 4.32
SEMA4B-212ENST00000559792 HMGXB3Q12766 1538 aa42.04■■■■■ 4.32
SEMA4B-212ENST00000559792 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.96■■■■■ 4.31
SEMA4B-212ENST00000559792 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.95■■■■■ 4.31
SEMA4B-212ENST00000559792 CUX2O14529 1486 aa41.91■■■■■ 4.3
SEMA4B-212ENST00000559792 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
SEMA4B-212ENST00000559792 NESP48681 1621 aa41.82■■■■■ 4.29
SEMA4B-212ENST00000559792 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.71■■■■■ 4.27
SEMA4B-212ENST00000559792 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.67■■■■■ 4.26
SEMA4B-212ENST00000559792 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.45■■■■■ 4.23
SEMA4B-212ENST00000559792 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
SEMA4B-212ENST00000559792 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.38■■■■■ 4.21
SEMA4B-212ENST00000559792 WIZO95785 1651 aa41.26■■■■■ 4.2
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SEMA4B-212ENST00000559792 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.02■■■■■ 4.16
SEMA4B-212ENST00000559792 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.87■■■■■ 4.13
SEMA4B-212ENST00000559792 WDR62O43379 1518 aa40.77■■■■■ 4.12
SEMA4B-212ENST00000559792 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.7■■■■■ 4.11
SEMA4B-212ENST00000559792 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
SEMA4B-212ENST00000559792 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.64■■■■■ 4.1
SEMA4B-212ENST00000559792 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.1
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SEMA4B-212ENST00000559792 PRDM2Q13029 1718 aa40.36■■■■■ 4.05
SEMA4B-212ENST00000559792 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
SEMA4B-212ENST00000559792 TRIM41Q8WV44 630 aa40.27■■■■■ 4.04
SEMA4B-212ENST00000559792 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.15■■■■■ 4.02
SEMA4B-212ENST00000559792 OSCARQ8IYS5 282 aa39.96■■■■□ 3.99
SEMA4B-212ENST00000559792 TOPBP1Q92547 1522 aa39.86■■■■□ 3.97
SEMA4B-212ENST00000559792 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
SEMA4B-212ENST00000559792 IFT140Q96RY7 1462 aa39.84■■■■□ 3.97
SEMA4B-212ENST00000559792 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.72■■■■□ 3.95
SEMA4B-212ENST00000559792 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
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SEMA4B-212ENST00000559792 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.61■■■■□ 3.93
SEMA4B-212ENST00000559792 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.61■■■■□ 3.93
SEMA4B-212ENST00000559792 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
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SEMA4B-212ENST00000559792 FBLN2P98095 1184 aa39.29■■■■□ 3.88
SEMA4B-212ENST00000559792 SOGA1O94964 1423 aa39.23■■■■□ 3.87
SEMA4B-212ENST00000559792 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.22■■■■□ 3.87
SEMA4B-212ENST00000559792 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
SEMA4B-212ENST00000559792 CUX1P39880 1505 aa39.16■■■■□ 3.86
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SEMA4B-212ENST00000559792 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.09■■■■□ 3.85
SEMA4B-212ENST00000559792 WDR97A6NE52 1622 aa39.05■■■■□ 3.84
SEMA4B-212ENST00000559792 ARAP1Q96P48 1450 aa39.01■■■■□ 3.84
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SEMA4B-212ENST00000559792 PBRM1Q86U86 1689 aa38.94■■■■□ 3.82
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SEMA4B-212ENST00000559792 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
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SEMA4B-212ENST00000559792 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.88■■■■□ 3.81
SEMA4B-212ENST00000559792 SYNJ1O43426 1573 aa38.87■■■■□ 3.81
SEMA4B-212ENST00000559792 SYNJ2O15056 1496 aa38.79■■■■□ 3.8
SEMA4B-212ENST00000559792 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.78■■■■□ 3.8
SEMA4B-212ENST00000559792 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.77■■■■□ 3.8
SEMA4B-212ENST00000559792 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.73■■■■□ 3.79
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SEMA4B-212ENST00000559792 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.54■■■■□ 3.76
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SEMA4B-212ENST00000559792 TOP2BQ02880 1626 aa38.5■■■■□ 3.75
SEMA4B-212ENST00000559792 ADAMTS12P58397 1594 aa38.45■■■■□ 3.75
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SEMA4B-212ENST00000559792 CEP170Q5SW79 1584 aa38.36■■■■□ 3.73
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SEMA4B-212ENST00000559792 NUP160Q12769 1436 aa38.25■■■■□ 3.71
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SEMA4B-212ENST00000559792 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.22■■■■□ 3.71
SEMA4B-212ENST00000559792 SHROOM2Q13796 1616 aa38.16■■■■□ 3.7
SEMA4B-212ENST00000559792 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
SEMA4B-212ENST00000559792 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.92■■■■□ 3.66
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SEMA4B-212ENST00000559792 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.82■■■■□ 3.65
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