Protein–RNA interactions for Protein: P04629

NTRK1, High affinity nerve growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK1P04629 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NTRK1P04629 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NTRK1P04629 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK1P04629 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NTRK1P04629 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NTRK1P04629 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NTRK1P04629 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK1P04629 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK1P04629 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NTRK1P04629 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NTRK1P04629 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK1P04629 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK1P04629 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NTRK1P04629 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NTRK1P04629 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NTRK1P04629 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NTRK1P04629 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NTRK1P04629 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NTRK1P04629 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NTRK1P04629 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms