Protein–RNA interactions for Protein: P04196

HRG, Histidine-rich glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRGP04196 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HRGP04196 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRGP04196 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRGP04196 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRGP04196 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRGP04196 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HRGP04196 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HRGP04196 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HRGP04196 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRGP04196 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRGP04196 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRGP04196 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRGP04196 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRGP04196 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRGP04196 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRGP04196 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HRGP04196 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRGP04196 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HRGP04196 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HRGP04196 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HRGP04196 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRGP04196 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRGP04196 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HRGP04196 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRGP04196 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRGP04196 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRGP04196 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HRGP04196 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HRGP04196 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HRGP04196 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HRGP04196 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HRGP04196 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HRGP04196 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HRGP04196 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HRGP04196 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HRGP04196 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HRGP04196 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HRGP04196 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HRGP04196 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HRGP04196 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HRGP04196 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HRGP04196 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HRGP04196 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HRGP04196 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRGP04196 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
HRGP04196 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HRGP04196 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRGP04196 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HRGP04196 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRGP04196 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HRGP04196 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HRGP04196 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HRGP04196 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HRGP04196 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HRGP04196 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HRGP04196 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HRGP04196 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HRGP04196 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HRGP04196 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HRGP04196 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HRGP04196 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HRGP04196 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HRGP04196 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HRGP04196 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HRGP04196 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HRGP04196 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HRGP04196 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HRGP04196 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HRGP04196 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HRGP04196 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HRGP04196 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HRGP04196 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HRGP04196 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HRGP04196 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HRGP04196 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HRGP04196 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HRGP04196 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HRGP04196 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HRGP04196 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HRGP04196 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HRGP04196 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HRGP04196 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HRGP04196 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HRGP04196 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HRGP04196 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HRGP04196 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HRGP04196 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HRGP04196 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HRGP04196 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HRGP04196 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HRGP04196 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HRGP04196 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HRGP04196 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HRGP04196 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRGP04196 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRGP04196 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HRGP04196 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HRGP04196 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRGP04196 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HRGP04196 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms