Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NCK2O43639 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NCK2O43639 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCK2O43639 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NCK2O43639 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NCK2O43639 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NCK2O43639 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NCK2O43639 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NCK2O43639 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCK2O43639 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCK2O43639 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCK2O43639 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCK2O43639 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCK2O43639 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NCK2O43639 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NCK2O43639 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NCK2O43639 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCK2O43639 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NCK2O43639 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NCK2O43639 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCK2O43639 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCK2O43639 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NCK2O43639 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCK2O43639 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NCK2O43639 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCK2O43639 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCK2O43639 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCK2O43639 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NCK2O43639 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCK2O43639 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCK2O43639 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCK2O43639 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCK2O43639 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCK2O43639 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NCK2O43639 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCK2O43639 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCK2O43639 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NCK2O43639 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCK2O43639 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NCK2O43639 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCK2O43639 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCK2O43639 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCK2O43639 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NCK2O43639 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCK2O43639 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCK2O43639 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCK2O43639 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCK2O43639 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCK2O43639 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCK2O43639 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCK2O43639 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCK2O43639 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCK2O43639 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCK2O43639 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCK2O43639 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NCK2O43639 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCK2O43639 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCK2O43639 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCK2O43639 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCK2O43639 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NCK2O43639 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCK2O43639 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCK2O43639 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCK2O43639 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NCK2O43639 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCK2O43639 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCK2O43639 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NCK2O43639 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCK2O43639 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCK2O43639 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCK2O43639 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCK2O43639 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCK2O43639 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCK2O43639 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCK2O43639 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCK2O43639 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCK2O43639 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCK2O43639 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NCK2O43639 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCK2O43639 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCK2O43639 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCK2O43639 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NCK2O43639 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCK2O43639 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCK2O43639 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCK2O43639 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCK2O43639 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCK2O43639 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCK2O43639 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCK2O43639 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCK2O43639 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCK2O43639 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NCK2O43639 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCK2O43639 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCK2O43639 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCK2O43639 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCK2O43639 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCK2O43639 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCK2O43639 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCK2O43639 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms