Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GIPC1O14908 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GIPC1O14908 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GIPC1O14908 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GIPC1O14908 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GIPC1O14908 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GIPC1O14908 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GIPC1O14908 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GIPC1O14908 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GIPC1O14908 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GIPC1O14908 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GIPC1O14908 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GIPC1O14908 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GIPC1O14908 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GIPC1O14908 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GIPC1O14908 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GIPC1O14908 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GIPC1O14908 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GIPC1O14908 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GIPC1O14908 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GIPC1O14908 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GIPC1O14908 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GIPC1O14908 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GIPC1O14908 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GIPC1O14908 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GIPC1O14908 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GIPC1O14908 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GIPC1O14908 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms