Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GIPC1O14908 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GIPC1O14908 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GIPC1O14908 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
GIPC1O14908 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GIPC1O14908 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
GIPC1O14908 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GIPC1O14908 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GIPC1O14908 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GIPC1O14908 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GIPC1O14908 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GIPC1O14908 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
GIPC1O14908 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GIPC1O14908 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
GIPC1O14908 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GIPC1O14908 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
GIPC1O14908 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GIPC1O14908 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
GIPC1O14908 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GIPC1O14908 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GIPC1O14908 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GIPC1O14908 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GIPC1O14908 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
GIPC1O14908 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GIPC1O14908 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
GIPC1O14908 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GIPC1O14908 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GIPC1O14908 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GIPC1O14908 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GIPC1O14908 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GIPC1O14908 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GIPC1O14908 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
GIPC1O14908 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
GIPC1O14908 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GIPC1O14908 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GIPC1O14908 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
GIPC1O14908 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GIPC1O14908 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GIPC1O14908 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GIPC1O14908 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GIPC1O14908 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GIPC1O14908 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
GIPC1O14908 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GIPC1O14908 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GIPC1O14908 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GIPC1O14908 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
GIPC1O14908 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GIPC1O14908 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GIPC1O14908 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GIPC1O14908 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
GIPC1O14908 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GIPC1O14908 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
GIPC1O14908 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GIPC1O14908 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GIPC1O14908 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GIPC1O14908 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GIPC1O14908 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GIPC1O14908 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GIPC1O14908 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GIPC1O14908 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GIPC1O14908 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GIPC1O14908 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GIPC1O14908 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GIPC1O14908 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GIPC1O14908 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GIPC1O14908 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GIPC1O14908 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GIPC1O14908 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GIPC1O14908 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GIPC1O14908 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GIPC1O14908 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GIPC1O14908 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GIPC1O14908 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GIPC1O14908 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GIPC1O14908 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GIPC1O14908 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GIPC1O14908 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GIPC1O14908 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GIPC1O14908 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GIPC1O14908 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GIPC1O14908 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GIPC1O14908 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GIPC1O14908 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GIPC1O14908 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GIPC1O14908 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GIPC1O14908 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GIPC1O14908 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GIPC1O14908 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GIPC1O14908 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GIPC1O14908 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GIPC1O14908 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GIPC1O14908 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GIPC1O14908 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GIPC1O14908 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GIPC1O14908 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
GIPC1O14908 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GIPC1O14908 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GIPC1O14908 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GIPC1O14908 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GIPC1O14908 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms