Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMX2-CTNND1H3BSU7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMX2-CTNND1H3BSU7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX2-CTNND1H3BSU7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX2-CTNND1H3BSU7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX2-CTNND1H3BSU7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX2-CTNND1H3BSU7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX2-CTNND1H3BSU7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms