Protein–RNA interactions for Protein: B1AHC4

PRR5-ARHGAP8, PRR5-ARHGAP8 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRR5-ARHGAP8B1AHC4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.2 ms