Protein–RNA interactions for Protein: A8MWV9

Putative uncharacterized protein LOC388820, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MWV9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A8MWV9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MWV9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MWV9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MWV9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MWV9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MWV9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A8MWV9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MWV9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MWV9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MWV9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MWV9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A8MWV9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MWV9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MWV9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MWV9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MWV9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MWV9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A8MWV9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
A8MWV9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MWV9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MWV9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MWV9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MWV9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
A8MWV9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MWV9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
A8MWV9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MWV9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MWV9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
A8MWV9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
A8MWV9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MWV9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MWV9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
A8MWV9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A8MWV9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
A8MWV9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A8MWV9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
A8MWV9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A8MWV9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A8MWV9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
A8MWV9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A8MWV9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
A8MWV9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
A8MWV9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A8MWV9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A8MWV9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
A8MWV9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
A8MWV9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
A8MWV9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A8MWV9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A8MWV9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
A8MWV9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
A8MWV9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A8MWV9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
A8MWV9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
A8MWV9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
A8MWV9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
A8MWV9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
A8MWV9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
A8MWV9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
A8MWV9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A8MWV9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
A8MWV9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
A8MWV9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A8MWV9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
A8MWV9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MWV9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MWV9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
A8MWV9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MWV9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MWV9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
A8MWV9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MWV9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MWV9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MWV9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MWV9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
A8MWV9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A8MWV9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
A8MWV9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MWV9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MWV9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
A8MWV9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
A8MWV9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
A8MWV9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MWV9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MWV9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MWV9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MWV9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MWV9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MWV9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
A8MWV9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MWV9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MWV9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MWV9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
A8MWV9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
A8MWV9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A8MWV9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
A8MWV9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
A8MWV9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
A8MWV9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms