Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
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