Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TTC26A0AVF1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TTC26A0AVF1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TTC26A0AVF1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC26A0AVF1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTC26A0AVF1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TTC26A0AVF1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms