Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-207ENST00000452385 2778 ntTSL 210.23□□□□□ -0.778e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 SF3B1-211ENST00000487698 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.788e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 EEF1A1-204ENST00000356303 635 ntTSL 29.45□□□□□ -0.98e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-208ENST00000580377 547 ntTSL 48.8□□□□□ -11e-9■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-223ENST00000488352 2509 ntTSL 1 (best)7.98□□□□□ -1.138e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 EIF3B-209ENST00000468250 602 ntTSL 27.75□□□□□ -1.178e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 EIF3B-205ENST00000463026 633 ntTSL 27.68□□□□□ -1.188e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 EIF3B-206ENST00000463229 552 ntTSL 57.22□□□□□ -1.258e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 DMTF1-229ENST00000580010 2370 nt6.11□□□□□ -1.438e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.58e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.548e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.618e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 SF3B1-203ENST00000414174 593 ntTSL 44.74□□□□□ -1.658e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 IMPDH2-212ENST00000496837 760 ntTSL 215.79■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 TRAP1-209ENST00000574175 535 ntTSL 517.6■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 27.8
UTP3Q9NQZ2 TRAP1-214ENST00000575854 595 ntTSL 313.39□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 27.8
UTP3Q9NQZ2 BLVRB-204ENST00000601346 676 ntTSL 213.23□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 27.8
UTP3Q9NQZ2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.857e-7■■■■■ 27.8
UTP3Q9NQZ2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.022e-6■■■■■ 27.8
UTP3Q9NQZ2 HDLBP-241ENST00000487169 4339 ntTSL 215.57■□□□□ 0.083e-12■■■■■ 27.8
UTP3Q9NQZ2 HDLBP-235ENST00000476807 1070 ntTSL 512□□□□□ -0.493e-12■■■■■ 27.8
UTP3Q9NQZ2 OGT-204ENST00000455587 632 ntTSL 39□□□□□ -0.971e-6■■■■■ 27.7
UTP3Q9NQZ2 CAPN2-210ENST00000492565 331 ntTSL 510.47□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 27.7
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-214ENST00000590556 575 ntTSL 220.55■□□□□ 0.884e-7■■■■■ 27.7
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-221ENST00000593026 657 ntTSL 316■□□□□ 0.154e-7■■■■■ 27.7
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-217ENST00000592391 1080 ntTSL 515.48■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 27.7
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-213ENST00000590315 566 ntTSL 513.87□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 27.7
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-219ENST00000592927 823 ntTSL 312.68□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 27.7
UTP3Q9NQZ2 TRAP1-212ENST00000575671 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 RSRC2-207ENST00000525335 1146 ntTSL 512.48□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.128e-10■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.218e-10■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 TPTEP1-202ENST00000400593 1430 ntTSL 1 (best)17.19■□□□□ 0.348e-10■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 AP000547.3-203ENST00000591299 751 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.358e-10■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.372e-8■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 PHGDH-231ENST00000641939 540 nt16.01■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 ACTN4-204ENST00000440400 3180 ntTSL 513.99□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-203ENST00000446331 1558 ntTSL 225.44■■□□□ 1.661e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.331e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.021e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-207ENST00000525607 1773 ntTSL 220.35■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-215ENST00000529464 932 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-204ENST00000525283 898 ntTSL 313.37□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 27.6
UTP3Q9NQZ2 C19orf48-214ENST00000602125 292 ntTSL 55.25□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 TMBIM6-209ENST00000547798 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.111e-6■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.431e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.411e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.011e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 PTDSS2-211ENST00000531411 624 ntTSL 215.56■□□□□ 0.081e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 RNF213-216ENST00000573548 616 ntTSL 214.25□□□□□ -0.131e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 NAPG-203ENST00000580483 1516 ntTSL 312.71□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 GMPPA-212ENST00000496536 302 ntTSL 511.17□□□□□ -0.621e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 NAPG-204ENST00000580746 743 ntTSL 211.14□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 NAPG-205ENST00000582472 694 ntTSL 510.52□□□□□ -0.731e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 NAPG-202ENST00000580224 1245 ntTSL 28.24□□□□□ -1.091e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.261e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 NAPG-206ENST00000582978 887 ntTSL 26.3□□□□□ -1.41e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 POLD2-205ENST00000436400 249 ntTSL 34.92□□□□□ -1.621e-9■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.256e-7■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.026e-7■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 27.5
UTP3Q9NQZ2 NET1-201ENST00000355029 3402 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 27.4
UTP3Q9NQZ2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 27.4
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-207ENST00000507660 550 ntTSL 310.82□□□□□ -0.687e-7■■■■■ 27.4
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-212ENST00000513581 683 ntTSL 210.62□□□□□ -0.717e-7■■■■■ 27.4
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-206ENST00000505028 552 ntTSL 47.31□□□□□ -1.247e-7■■■■■ 27.4
UTP3Q9NQZ2 THAP9-AS1-203ENST00000504718 573 ntTSL 47.09□□□□□ -1.277e-7■■■■■ 27.4
UTP3Q9NQZ2 TMEM63B-210ENST00000534326 1934 ntTSL 213.84□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 27.4
UTP3Q9NQZ2 FLNA-213ENST00000466325 828 ntTSL 216.73■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 27.4
UTP3Q9NQZ2 FLNA-205ENST00000415241 704 ntTSL 516.15■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 27.4
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.163e-9■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.342e-9■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.242e-9■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 CRELD1-209ENST00000482691 690 ntTSL 314.81□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 CRELD1-210ENST00000489674 437 ntTSL 513.34□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 IMPDH2-210ENST00000485500 852 ntTSL 311.87□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 IMPDH2-203ENST00000442157 865 ntTSL 210.34□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)19.97■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.62e-6■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 NDUFV1-208ENST00000526770 1748 ntTSL 519.84■□□□□ 0.774e-7■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 RBM39-210ENST00000425184 526 ntTSL 37.71□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 27.3
UTP3Q9NQZ2 RPS9-210ENST00000460761 644 ntTSL 215.43■□□□□ 0.064e-9■■■■■ 27.2
UTP3Q9NQZ2 RBM39-232ENST00000481037 687 ntTSL 311.14□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 27.2
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