RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482691.1

CRELD1-209, Transcript of cysteine rich with EGF like domains 1, humanhuman

TSL 3

Gene CRELD1, Length 690 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1-209ENST00000482691 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.96■■■■□ 3.19
CRELD1-209ENST00000482691 ABCC9O60706 1549 aa31.83■■■□□ 2.69
CRELD1-209ENST00000482691 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.44■■■□□ 2.62
CRELD1-209ENST00000482691 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.17■■■□□ 2.42
CRELD1-209ENST00000482691 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.03■■■□□ 2.4
CRELD1-209ENST00000482691 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.92■■■□□ 2.38
CRELD1-209ENST00000482691 NACADO15069 1562 aa29.87■■■□□ 2.37
CRELD1-209ENST00000482691 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.65■■■□□ 2.34
CRELD1-209ENST00000482691 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.31■■■□□ 2.28
CRELD1-209ENST00000482691 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.26■■■□□ 2.27
CRELD1-209ENST00000482691 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.14■■■□□ 2.26
CRELD1-209ENST00000482691 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CRELD1-209ENST00000482691 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.85■■■□□ 2.21
CRELD1-209ENST00000482691 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.83■■■□□ 2.21
CRELD1-209ENST00000482691 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.72■■■□□ 2.19
CRELD1-209ENST00000482691 SCRIBQ14160 1630 aa28.69■■■□□ 2.18
CRELD1-209ENST00000482691 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.65■■■□□ 2.18
CRELD1-209ENST00000482691 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CRELD1-209ENST00000482691 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.9■■■□□ 2.06
CRELD1-209ENST00000482691 ERCC6Q03468 1493 aa27.61■■■□□ 2.01
CRELD1-209ENST00000482691 NCAPD3P42695 1498 aa27.57■■■□□ 2
CRELD1-209ENST00000482691 CUX2O14529 1486 aa27.55■■■□□ 2
CRELD1-209ENST00000482691 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.43■■□□□ 1.98
CRELD1-209ENST00000482691 SMARCA2P51531 1590 aa27.39■■□□□ 1.98
CRELD1-209ENST00000482691 HMGXB3Q12766 1538 aa27.31■■□□□ 1.96
CRELD1-209ENST00000482691 SMARCA4P51532 1647 aa27.3■■□□□ 1.96
CRELD1-209ENST00000482691 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CRELD1-209ENST00000482691 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CRELD1-209ENST00000482691 NESP48681 1621 aa27.19■■□□□ 1.94
CRELD1-209ENST00000482691 PEG3Q9GZU2 1588 aa27■■□□□ 1.91
CRELD1-209ENST00000482691 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27■■□□□ 1.91
CRELD1-209ENST00000482691 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.97■■□□□ 1.91
CRELD1-209ENST00000482691 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.9■■□□□ 1.9
CRELD1-209ENST00000482691 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CRELD1-209ENST00000482691 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.77■■□□□ 1.88
CRELD1-209ENST00000482691 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.77■■□□□ 1.88
CRELD1-209ENST00000482691 TRIM41Q8WV44 630 aa26.67■■□□□ 1.86
CRELD1-209ENST00000482691 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.67■■□□□ 1.86
CRELD1-209ENST00000482691 WIZO95785 1651 aa26.55■■□□□ 1.84
CRELD1-209ENST00000482691 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.54■■□□□ 1.84
CRELD1-209ENST00000482691 WDR62O43379 1518 aa26.54■■□□□ 1.84
CRELD1-209ENST00000482691 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.46■■□□□ 1.83
CRELD1-209ENST00000482691 OSCARQ8IYS5 282 aa26.37■■□□□ 1.81
CRELD1-209ENST00000482691 CFTRP13569 1480 aa26.35■■□□□ 1.81
CRELD1-209ENST00000482691 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
CRELD1-209ENST00000482691 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
CRELD1-209ENST00000482691 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CRELD1-209ENST00000482691 IFT140Q96RY7 1462 aa26■■□□□ 1.75
CRELD1-209ENST00000482691 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.97■■□□□ 1.75
CRELD1-209ENST00000482691 PRDM2Q13029 1718 aa25.95■■□□□ 1.74
CRELD1-209ENST00000482691 ABCC8Q09428 1581 aa25.91■■□□□ 1.74
CRELD1-209ENST00000482691 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CRELD1-209ENST00000482691 TOPBP1Q92547 1522 aa25.88■■□□□ 1.73
CRELD1-209ENST00000482691 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.86■■□□□ 1.73
CRELD1-209ENST00000482691 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.86■■□□□ 1.73
CRELD1-209ENST00000482691 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.86■■□□□ 1.73
CRELD1-209ENST00000482691 ARHGEF11O15085 1522 aa25.79■■□□□ 1.72
CRELD1-209ENST00000482691 FBLN2P98095 1184 aa25.79■■□□□ 1.72
CRELD1-209ENST00000482691 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.78■■□□□ 1.72
CRELD1-209ENST00000482691 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.76■■□□□ 1.71
CRELD1-209ENST00000482691 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
CRELD1-209ENST00000482691 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.711e-6■■□□□ 13.6
CRELD1-209ENST00000482691 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CRELD1-209ENST00000482691 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
CRELD1-209ENST00000482691 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CRELD1-209ENST00000482691 CHD1O14646 1710 aa25.57■■□□□ 1.68
CRELD1-209ENST00000482691 SOGA1O94964 1423 aa25.57■■□□□ 1.68
CRELD1-209ENST00000482691 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CRELD1-209ENST00000482691 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CRELD1-209ENST00000482691 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.52■■□□□ 1.68
CRELD1-209ENST00000482691 ARAP1Q96P48 1450 aa25.49■■□□□ 1.67
CRELD1-209ENST00000482691 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.43■■□□□ 1.66
CRELD1-209ENST00000482691 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.41■■□□□ 1.66
CRELD1-209ENST00000482691 WDR97A6NE52 1622 aa25.39■■□□□ 1.66
CRELD1-209ENST00000482691 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CRELD1-209ENST00000482691 SYNJ1O43426 1573 aa25.36■■□□□ 1.65
CRELD1-209ENST00000482691 GRIN2BQ13224 1484 aa25.36■■□□□ 1.65
CRELD1-209ENST00000482691 CUX1P39880 1505 aa25.3■■□□□ 1.64
CRELD1-209ENST00000482691 SYNJ2O15056 1496 aa25.29■■□□□ 1.64
CRELD1-209ENST00000482691 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.28■■□□□ 1.64
CRELD1-209ENST00000482691 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.22■■□□□ 1.63
CRELD1-209ENST00000482691 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CRELD1-209ENST00000482691 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CRELD1-209ENST00000482691 PBRM1Q86U86 1689 aa25.1■■□□□ 1.61
CRELD1-209ENST00000482691 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.09■■□□□ 1.61
CRELD1-209ENST00000482691 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
CRELD1-209ENST00000482691 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.01■■□□□ 1.59
CRELD1-209ENST00000482691 GRIN2AQ12879 1464 aa25■■□□□ 1.59
CRELD1-209ENST00000482691 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.9■■□□□ 1.58
CRELD1-209ENST00000482691 NUP160Q12769 1436 aa24.88■■□□□ 1.57
CRELD1-209ENST00000482691 ADAMTS12P58397 1594 aa24.88■■□□□ 1.57
CRELD1-209ENST00000482691 CEP170Q5SW79 1584 aa24.86■■□□□ 1.57
CRELD1-209ENST00000482691 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.84■■□□□ 1.57
CRELD1-209ENST00000482691 TOP2BQ02880 1626 aa24.83■■□□□ 1.56
CRELD1-209ENST00000482691 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.79■■□□□ 1.56
CRELD1-209ENST00000482691 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.79■■□□□ 1.56
CRELD1-209ENST00000482691 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
CRELD1-209ENST00000482691 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CRELD1-209ENST00000482691 JPH4Q96JJ6 628 aa24.76■■□□□ 1.55
CRELD1-209ENST00000482691 SHROOM2Q13796 1616 aa24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms