Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 RAD51B-219ENST00000554244 669 ntTSL 36.34□□□□□ -1.394e-7■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 RAD51B-214ENST00000497460 546 ntTSL 45.84□□□□□ -1.474e-7■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 RAD51B-216ENST00000553595 795 ntTSL 34.78□□□□□ -1.644e-7■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 DAZAP1-209ENST00000590419 508 ntTSL 315.03■□□□□ -05e-7■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC13.53□□□□□ -0.243e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.813e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.893e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.933e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.943e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.013e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.013e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.063e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.063e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.063e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.093e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)7.95□□□□□ -1.143e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 CD46-211ENST00000464082 567 ntTSL 25.47□□□□□ -1.533e-6■■■□□ 15.7
SLTMQ9NWH9 RREB1-205ENST00000467782 243 ntTSL 516.66■□□□□ 0.261e-9■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 RREB1-207ENST00000475946 9067 ntTSL 1 (best)10.3□□□□□ -0.761e-9■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 BCAR1-221ENST00000569006 574 ntTSL 415.35■□□□□ 0.052e-7■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.254e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.445e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 ITCH-206ENST00000486883 703 ntTSL 25.69□□□□□ -1.55e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.645e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.675e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 UBE2G2-203ENST00000462569 762 ntTSL 221.91■■□□□ 1.13e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 UBE2G2-205ENST00000478200 637 ntTSL 421.91■■□□□ 1.13e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 UBE2G2-212ENST00000497664 590 ntTSL 421.91■■□□□ 1.13e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 UBE2G2-209ENST00000491513 744 ntTSL 420.03■□□□□ 0.83e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 UBE2G2-211ENST00000497630 933 ntTSL 219.86■□□□□ 0.773e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 UBE2G2-204ENST00000477954 1034 ntTSL 316.52■□□□□ 0.243e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.233e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.113e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 UBE2G2-208ENST00000490450 424 ntTSL 37.8□□□□□ -1.163e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 UBE2G2-210ENST00000496395 288 ntTSL 56.14□□□□□ -1.433e-6■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 MAP3K11-206ENST00000527304 5605 nt18.93■□□□□ 0.629e-7■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.419e-7■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 MAP3K11-204ENST00000526293 571 ntTSL 415.33■□□□□ 0.049e-7■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 MAP3K11-207ENST00000529839 561 ntTSL 414.89□□□□□ -0.039e-7■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 EEF1D-214ENST00000526135 535 ntTSL 213.33□□□□□ -0.286e-12■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.045e-9■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 RRBP1-205ENST00000398782 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 225.28■■□□□ 1.645e-7■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 NEU4-215ENST00000488997 541 ntTSL 422.88■■□□□ 1.253e-7■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 NEU4-212ENST00000435894 484 ntTSL 422.22■■□□□ 1.153e-7■■■□□ 15.6
SLTMQ9NWH9 PRR5-211ENST00000475850 1965 ntTSL 219.35■□□□□ 0.694e-6■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.619e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.164e-6■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 ZBTB1-205ENST00000556818 453 ntTSL 419.63■□□□□ 0.738e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 ZBTB1-202ENST00000553583 582 ntTSL 315.74■□□□□ 0.118e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 ZBTB1-203ENST00000554015 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.428e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 ZBTB1-206ENST00000556965 509 ntTSL 43.32□□□□□ -1.888e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.825e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 LINC00511-202ENST00000457958 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.255e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 LINC00511-214ENST00000581801 379 ntTSL 311.33□□□□□ -0.65e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 LINC00511-210ENST00000580861 467 ntTSL 49.22□□□□□ -0.935e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 EP400NL-208ENST00000475841 7090 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.444e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 518.72■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 AGPAT3-214ENST00000481319 616 ntTSL 314.94□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 SGSH-209ENST00000572257 581 ntTSL 411.41□□□□□ -0.582e-6■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 C1orf159-206ENST00000427787 575 ntTSL 517.58■□□□□ 0.42e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 C1orf159-208ENST00000442117 554 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.16■□□□□ 0.182e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 DOT1L-203ENST00000452696 624 ntTSL 315.37■□□□□ 0.051e-6■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.033e-6■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 215.11■□□□□ 0.014e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.719e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 217.61■□□□□ 0.417e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.732e-6■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.33e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.437e-7■■■□□ 15.5
SLTMQ9NWH9 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 217.39■□□□□ 0.373e-8■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 515.09■□□□□ 0.013e-8■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)14.68□□□□□ -0.063e-8■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.183e-6■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.023e-6■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.013e-6■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.922e-17■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.473e-6■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-17■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.595e-6■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.345e-6■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.093e-8■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.423e-8■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 ARID1A-216ENST00000637465 699 ntTSL 54.67□□□□□ -1.663e-8■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.742e-10■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.672e-10■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-6■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 AEBP2-207ENST00000541908 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.082e-10■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 AEBP2-206ENST00000538425 518 ntAPPRIS ALT2 TSL 47.26□□□□□ -1.252e-10■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -02e-6■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PKP4-204ENST00000421462 3099 ntTSL 217.76■□□□□ 0.432e-7■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)17.24■□□□□ 0.352e-7■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PKP4-206ENST00000452162 2359 ntTSL 1 (best)11.39□□□□□ -0.592e-7■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-7■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PKP4-203ENST00000411900 552 ntTSL 410.39□□□□□ -0.752e-7■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.832e-7■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PKP4-207ENST00000457109 520 ntTSL 39.14□□□□□ -0.952e-7■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.152e-7■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.282e-8■■■□□ 15.4
SLTMQ9NWH9 HOXB3-213ENST00000552000 466 ntTSL 35.43□□□□□ -1.547e-7■■■□□ 15.4
Retrieved 100 of 8,230 protein–RNA pairs in 44.7 ms