Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 BSDC1-215ENST00000531222 562 ntTSL 315.28■□□□□ 0.043e-7■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 SAFB-214ENST00000592707 940 ntTSL 214.7□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 TADA3-205ENST00000492103 1868 ntTSL 213.65□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 TRIP12-214ENST00000477441 581 ntTSL 38.58□□□□□ -1.043e-7■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 COPA-205ENST00000541366 616 ntTSL 212.43□□□□□ -0.421e-13■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 COPA-206ENST00000545266 574 ntTSL 210.32□□□□□ -0.761e-13■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 UBR4-205ENST00000417040 6175 ntTSL 514.31□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 30.3
UTP3Q9NQZ2 BHLHE40-201ENST00000256495 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 MAPK8IP3-213ENST00000568271 752 ntTSL 515.42■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 RHOT2-223ENST00000569706 588 ntTSL 324.97■■□□□ 1.591e-10■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 PKD1-224ENST00000561991 964 ntTSL 519.04■□□□□ 0.649e-8■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 FGFR3-207ENST00000474521 545 ntTSL 218.8■□□□□ 0.61e-10■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 PKD1-234ENST00000567946 1822 ntTSL 517.7■□□□□ 0.429e-8■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 PKD1-222ENST00000496574 4419 ntTSL 515.91■□□□□ 0.149e-8■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 UQCC1-216ENST00000473982 551 ntTSL 415.49■□□□□ 0.071e-10■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 PKD1-219ENST00000486339 4443 ntTSL 515.34■□□□□ 0.059e-8■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 UQCC1-215ENST00000472559 1921 ntTSL 1 (best)14.21□□□□□ -0.131e-10■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 UQCC1-221ENST00000496812 801 ntTSL 311.61□□□□□ -0.551e-10■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 SRRM1-214ENST00000485541 679 ntTSL 58.38□□□□□ -1.071e-10■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.83e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG7-202ENST00000416970 789 ntTSL 1 (best)25.32■■□□□ 1.643e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.553e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.294e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 DYRK3-204ENST00000441486 870 ntTSL 221.01■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 DYRK3-205ENST00000489878 1772 ntTSL 1 (best)20.36■□□□□ 0.853e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC7-202ENST00000344861 2727 ntTSL 1 (best)17.75■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.433e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC7-208ENST00000569488 620 ntTSL 314.4□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 30.2
UTP3Q9NQZ2 HDAC7-222ENST00000477937 410 ntTSL 514.67□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 30.1
UTP3Q9NQZ2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.035e-44■■■■■ 30.1
UTP3Q9NQZ2 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.415e-44■■■■■ 30.1
UTP3Q9NQZ2 RPS16-206ENST00000601390 2389 ntTSL 212.06□□□□□ -0.485e-44■■■■■ 30.1
UTP3Q9NQZ2 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.725e-44■■■■■ 30.1
UTP3Q9NQZ2 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.81□□□□□ -2.281e-10■■■■■ 30.1
UTP3Q9NQZ2 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 30.1
UTP3Q9NQZ2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.894e-6■■■■■ 30.1
UTP3Q9NQZ2 LMNB1-205ENST00000472034 730 ntTSL 35.65□□□□□ -1.54e-6■■■■■ 30.1
UTP3Q9NQZ2 RPS3-214ENST00000530164 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 30.1
UTP3Q9NQZ2 UBR4-216ENST00000494503 598 ntTSL 310.22□□□□□ -0.779e-8■■■■■ 30
UTP3Q9NQZ2 VPS28-215ENST00000531924 695 ntTSL 315.61■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 30
UTP3Q9NQZ2 PIEZO1-212ENST00000497793 1228 ntTSL 219.73■□□□□ 0.756e-7■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.386e-7■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 FAR1-203ENST00000527202 603 ntTSL 29.48□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 PIEZO1-204ENST00000466823 584 ntTSL 28.78□□□□□ -16e-7■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 RBM39-212ENST00000429968 2149 ntTSL 215.2■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 RBM39-216ENST00000444878 2124 ntTSL 214.8□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 RBM39-245ENST00000639702 5914 ntTSL 514.59□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 RBM39-206ENST00000403542 2883 ntTSL 213.16□□□□□ -0.31e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 RBM39-223ENST00000463004 4580 ntTSL 513.05□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 RBM39-202ENST00000338163 2792 ntTSL 212.71□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 RBM39-221ENST00000461283 2415 ntTSL 53.82□□□□□ -1.81e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 AHCYL1-205ENST00000475081 795 ntTSL 522.01■■□□□ 1.112e-11■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 PSMD2-218ENST00000491494 371 ntTSL 218.22■□□□□ 0.515e-9■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-217ENST00000521414 2349 ntTSL 216.78■□□□□ 0.284e-7■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-216ENST00000521026 2145 ntTSL 215.26■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 AGO2-206ENST00000520412 614 ntTSL 211.88□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-212ENST00000519278 3983 ntTSL 210.44□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 AGO2-207ENST00000520628 350 ntTSL 210.14□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.983e-9■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.923e-9■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 SUGP2-209ENST00000597280 814 ntTSL 314.63□□□□□ -0.073e-8■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.586e-7■■■■■ 29.9
UTP3Q9NQZ2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.45e-7■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.881e-6■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.761e-6■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 UBE3C-204ENST00000469336 655 ntTSL 29.66□□□□□ -0.862e-14■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.188e-9■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 AHCYL1-201ENST00000359172 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.618e-9■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 59.85□□□□□ -0.831e-7■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 AHCYL1-204ENST00000469401 575 ntTSL 29.66□□□□□ -0.868e-9■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 AHCYL1-206ENST00000481423 732 ntTSL 38.12□□□□□ -1.118e-9■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 SAFB-204ENST00000586934 995 ntTSL 519.79■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 CDCA5-203ENST00000462902 569 ntTSL 410.51□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 29.8
UTP3Q9NQZ2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.886e-7■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.546e-7■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.256e-7■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 XPO1-220ENST00000481214 720 ntTSL 26.73□□□□□ -1.335e-8■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 SKIV2L-207ENST00000471818 706 ntTSL 517.07■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 ATP5D-208ENST00000592624 1587 nt21.14■□□□□ 0.985e-6■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.935e-6■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 ATP5D-203ENST00000588538 1393 ntTSL 1 (best)20.29■□□□□ 0.845e-6■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 ATP5D-205ENST00000590265 1144 ntTSL 1 (best)20.03■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.85e-6■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 ATP5D-206ENST00000591249 405 ntTSL 517.71■□□□□ 0.435e-6■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.215e-6■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.039e-9■■■■■ 29.7
UTP3Q9NQZ2 PANK3-202ENST00000520504 313 ntTSL 55□□□□□ -1.619e-9■■■■■ 29.7
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