Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 ANP32B-202ENST00000473205 687 ntTSL 313.34□□□□□ -0.277e-12■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 XPO1-215ENST00000468259 600 ntTSL 57.85□□□□□ -1.158e-8■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 XPO1-218ENST00000476585 342 ntTSL 27.55□□□□□ -1.28e-8■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 ACAP3-213ENST00000493992 326 ntTSL 521.99■■□□□ 1.113e-6■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.044e-6■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 PTBP3-201ENST00000210227 734 ntTSL 220.54■□□□□ 0.884e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-223ENST00000511662 441 ntTSL 520.36■□□□□ 0.856e-21■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 GRN-205ENST00000586443 1557 ntTSL 320.26■□□□□ 0.834e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-205ENST00000577411 562 ntTSL 519.6■□□□□ 0.734e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-206ENST00000577431 583 ntTSL 519.6■□□□□ 0.734e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-211ENST00000580050 476 ntTSL 419.6■□□□□ 0.734e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-220ENST00000584634 588 ntTSL 419.25■□□□□ 0.674e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.334e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 GRN-204ENST00000586242 665 ntTSL 316.83■□□□□ 0.284e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-227ENST00000513641 577 ntTSL 516.69■□□□□ 0.266e-21■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.264e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-217ENST00000583210 512 ntTSL 416.63■□□□□ 0.254e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-211ENST00000507210 582 ntTSL 316.37■□□□□ 0.216e-21■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 WDR55-202ENST00000504897 2953 ntTSL 216.3■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.084e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 WDR55-205ENST00000520764 1696 ntTSL 215.24■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 PITRM1-207ENST00000451454 875 ntTSL 314.45□□□□□ -0.13e-6■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-220ENST00000509963 432 ntTSL 214.15□□□□□ -0.146e-21■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-215ENST00000508996 348 ntTSL 414.02□□□□□ -0.176e-21■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-219ENST00000509664 538 ntTSL 513.02□□□□□ -0.336e-21■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 NFE2L1-208ENST00000579537 372 ntTSL 413□□□□□ -0.334e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-217ENST00000509164 563 ntTSL 412.81□□□□□ -0.366e-21■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-228ENST00000514981 653 ntTSL 312.42□□□□□ -0.426e-21■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-212ENST00000507546 496 ntTSL 211.55□□□□□ -0.566e-21■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 CRK-203ENST00000572145 830 ntTSL 310.58□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 CASC3-205ENST00000577605 714 ntTSL 37.44□□□□□ -1.224e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 SERPINB1-203ENST00000468511 449 ntTSL 36.65□□□□□ -1.344e-11■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 OCIAD1-208ENST00000504654 552 ntTSL 35.9□□□□□ -1.466e-21■■■■■ 35.3
UTP3Q9NQZ2 NDUFV1-207ENST00000526169 774 ntTSL 1 (best)21.01■□□□□ 0.954e-17■■■■■ 35.2
UTP3Q9NQZ2 NDUFV1-210ENST00000527923 594 ntTSL 220.4■□□□□ 0.864e-17■■■■■ 35.2
UTP3Q9NQZ2 NDUFV1-209ENST00000527355 679 ntTSL 215.25■□□□□ 0.034e-17■■■■■ 35.2
UTP3Q9NQZ2 NDUFV1-226ENST00000533919 774 ntTSL 315.25■□□□□ 0.034e-17■■■■■ 35.2
UTP3Q9NQZ2 MED15-225ENST00000477824 571 ntTSL 522.43■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 35.2
UTP3Q9NQZ2 MED15-215ENST00000444094 551 ntTSL 421.12■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 35.2
UTP3Q9NQZ2 MED15-205ENST00000414658 717 ntTSL 320.02■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 35.2
UTP3Q9NQZ2 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 35.2
UTP3Q9NQZ2 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 35.2
UTP3Q9NQZ2 FAM126A-208ENST00000477349 544 ntTSL 410.98□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 35.2
UTP3Q9NQZ2 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.291e-6■■■■■ 35.1
UTP3Q9NQZ2 TRAP1-208ENST00000573872 656 ntTSL 314.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 35.1
UTP3Q9NQZ2 PABPC1L-216ENST00000490798 1384 ntTSL 320.59■□□□□ 0.896e-7■■■■■ 35.1
UTP3Q9NQZ2 UFD1-210ENST00000494054 588 ntTSL 510.39□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 UFD1-207ENST00000474226 293 ntTSL 58.14□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 TRIM27-203ENST00000414543 1813 ntTSL 311.09□□□□□ -0.635e-9■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 TRIM27-204ENST00000467742 541 ntTSL 26.59□□□□□ -1.355e-9■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 GTPBP2-201ENST00000307114 2830 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 GTPBP2-208ENST00000476510 2816 ntTSL 512.13□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.853e-6■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 35
UTP3Q9NQZ2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.26■□□□□ 0.833e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.63e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 SSBP1-207ENST00000468267 800 ntTSL 218.18■□□□□ 0.53e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 34.9
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UTP3Q9NQZ2 SSBP1-206ENST00000467681 630 ntTSL 214.56□□□□□ -0.083e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 SSBP1-202ENST00000461433 1694 ntTSL 1 (best)12.11□□□□□ -0.473e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 SSBP1-212ENST00000489378 1434 ntTSL 29.67□□□□□ -0.863e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 SSBP1-208ENST00000469123 662 ntTSL 59.06□□□□□ -0.963e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 POM121C-201ENST00000398379 715 ntTSL 29□□□□□ -0.973e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 SSBP1-204ENST00000465167 517 ntTSL 57.7□□□□□ -1.183e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 SSBP1-213ENST00000496622 2620 ntTSL 1 (best)7.23□□□□□ -1.253e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.831e-8■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 CNOT3-203ENST00000440571 1125 ntTSL 524.12■■□□□ 1.454e-7■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 CANX-207ENST00000503303 345 ntTSL 58.42□□□□□ -1.061e-36■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP11B-203ENST00000563110 2043 ntTSL 1 (best)18.1■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-221ENST00000582844 957 ntTSL 522.63■■□□□ 1.215e-7■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 217.95■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-223ENST00000584472 586 ntTSL 417.09■□□□□ 0.335e-7■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-213ENST00000580446 612 ntTSL 314.81□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-211ENST00000579316 692 ntTSL 214.66□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-219ENST00000581660 611 ntTSL 514.66□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-207ENST00000578194 567 ntTSL 413.54□□□□□ -0.245e-7■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 CSNK1D-226ENST00000585026 563 ntTSL 511.36□□□□□ -0.595e-7■■■■■ 34.9
UTP3Q9NQZ2 MAPRE3-204ENST00000458529 878 ntTSL 510.41□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 MAPRE3-202ENST00000402218 1001 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-216ENST00000488340 1598 ntTSL 223.69■■□□□ 1.389e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.99e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-213ENST00000481223 2815 ntTSL 220.24■□□□□ 0.839e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 CCNL2-218ENST00000496007 4452 ntTSL 215.11■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 EEF2-201ENST00000309311 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.316e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)15.1■□□□□ 0.011e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.521e-7■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 CROCCP2-203ENST00000635081 1904 ntTSL 522.27■■□□□ 1.165e-6■■■■■ 34.8
UTP3Q9NQZ2 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.016e-11■■■■■ 34.8
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