RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577431.1

NFE2L1-206, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, humanhuman

TSL 5

Gene NFE2L1, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L1-206ENST00000577431 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.45■■■■■ 4.55
NFE2L1-206ENST00000577431 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.34■■■■□ 3.73
NFE2L1-206ENST00000577431 ABCC9O60706 1549 aa37.32■■■■□ 3.57
NFE2L1-206ENST00000577431 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.35■■■■□ 3.41
NFE2L1-206ENST00000577431 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
NFE2L1-206ENST00000577431 NACADO15069 1562 aa36.04■■■■□ 3.36
NFE2L1-206ENST00000577431 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.98■■■■□ 3.35
NFE2L1-206ENST00000577431 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.93■■■■□ 3.34
NFE2L1-206ENST00000577431 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.92■■■■□ 3.34
NFE2L1-206ENST00000577431 SCRIBQ14160 1630 aa35.11■■■■□ 3.21
NFE2L1-206ENST00000577431 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.09■■■■□ 3.21
NFE2L1-206ENST00000577431 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.03■■■■□ 3.2
NFE2L1-206ENST00000577431 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.87■■■■□ 3.17
NFE2L1-206ENST00000577431 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.68■■■■□ 3.14
NFE2L1-206ENST00000577431 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.98■■■■□ 3.03
NFE2L1-206ENST00000577431 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
NFE2L1-206ENST00000577431 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.85■■■■□ 3.01
NFE2L1-206ENST00000577431 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.71■■■□□ 2.99
NFE2L1-206ENST00000577431 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
NFE2L1-206ENST00000577431 SMARCA4P51532 1647 aa33.59■■■□□ 2.97
NFE2L1-206ENST00000577431 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.51■■■□□ 2.95
NFE2L1-206ENST00000577431 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.38■■■□□ 2.93
NFE2L1-206ENST00000577431 SMARCA2P51531 1590 aa33.31■■■□□ 2.92
NFE2L1-206ENST00000577431 NCAPD3P42695 1498 aa33.3■■■□□ 2.92
NFE2L1-206ENST00000577431 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
NFE2L1-206ENST00000577431 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.23■■■□□ 2.91
NFE2L1-206ENST00000577431 WIZO95785 1651 aa33.13■■■□□ 2.89
NFE2L1-206ENST00000577431 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
NFE2L1-206ENST00000577431 HMGXB3Q12766 1538 aa33.1■■■□□ 2.89
NFE2L1-206ENST00000577431 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
NFE2L1-206ENST00000577431 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
NFE2L1-206ENST00000577431 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.48■■■□□ 2.79
NFE2L1-206ENST00000577431 NESP48681 1621 aa32.4■■■□□ 2.78
NFE2L1-206ENST00000577431 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.39■■■□□ 2.78
NFE2L1-206ENST00000577431 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.3■■■□□ 2.76
NFE2L1-206ENST00000577431 CFTRP13569 1480 aa32.23■■■□□ 2.75
NFE2L1-206ENST00000577431 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.16■■■□□ 2.74
NFE2L1-206ENST00000577431 ERCC6Q03468 1493 aa32.14■■■□□ 2.74
NFE2L1-206ENST00000577431 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.99■■■□□ 2.71
NFE2L1-206ENST00000577431 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.92■■■□□ 2.7
NFE2L1-206ENST00000577431 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.89■■■□□ 2.7
NFE2L1-206ENST00000577431 PRDM2Q13029 1718 aa31.86■■■□□ 2.69
NFE2L1-206ENST00000577431 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.77■■■□□ 2.68
NFE2L1-206ENST00000577431 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
NFE2L1-206ENST00000577431 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
NFE2L1-206ENST00000577431 WDR62O43379 1518 aa31.61■■■□□ 2.65
NFE2L1-206ENST00000577431 CUX2O14529 1486 aa31.61■■■□□ 2.65
NFE2L1-206ENST00000577431 ABCC8Q09428 1581 aa31.51■■■□□ 2.64
NFE2L1-206ENST00000577431 TOPBP1Q92547 1522 aa31.5■■■□□ 2.63
NFE2L1-206ENST00000577431 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.47■■■□□ 2.63
NFE2L1-206ENST00000577431 CUX1P39880 1505 aa31.4■■■□□ 2.62
NFE2L1-206ENST00000577431 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.38■■■□□ 2.61
NFE2L1-206ENST00000577431 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
NFE2L1-206ENST00000577431 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.25■■■□□ 2.59
NFE2L1-206ENST00000577431 IFT140Q96RY7 1462 aa31.22■■■□□ 2.59
NFE2L1-206ENST00000577431 SYNJ1O43426 1573 aa31.22■■■□□ 2.59
NFE2L1-206ENST00000577431 SOGA1O94964 1423 aa31.2■■■□□ 2.59
NFE2L1-206ENST00000577431 TOP2BQ02880 1626 aa31.2■■■□□ 2.58
NFE2L1-206ENST00000577431 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.17■■■□□ 2.58
NFE2L1-206ENST00000577431 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.15■■■□□ 2.58
NFE2L1-206ENST00000577431 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
NFE2L1-206ENST00000577431 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
NFE2L1-206ENST00000577431 TRIM41Q8WV44 630 aa31■■■□□ 2.55
NFE2L1-206ENST00000577431 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
NFE2L1-206ENST00000577431 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.97■■■□□ 2.555e-10■■■■■ 28.8
NFE2L1-206ENST00000577431 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.96■■■□□ 2.55
NFE2L1-206ENST00000577431 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
NFE2L1-206ENST00000577431 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.86■■■□□ 2.53
NFE2L1-206ENST00000577431 WDR97A6NE52 1622 aa30.85■■■□□ 2.53
NFE2L1-206ENST00000577431 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.82■■■□□ 2.52
NFE2L1-206ENST00000577431 GRIN2BQ13224 1484 aa30.75■■■□□ 2.51
NFE2L1-206ENST00000577431 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.73■■■□□ 2.51
NFE2L1-206ENST00000577431 KIF27Q86VH2 1401 aa30.7■■■□□ 2.5
NFE2L1-206ENST00000577431 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.65■■■□□ 2.5
NFE2L1-206ENST00000577431 FBLN2P98095 1184 aa30.6■■■□□ 2.49
NFE2L1-206ENST00000577431 PBRM1Q86U86 1689 aa30.6■■■□□ 2.49
NFE2L1-206ENST00000577431 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
NFE2L1-206ENST00000577431 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.57■■■□□ 2.48
NFE2L1-206ENST00000577431 IGF1RP08069 1367 aa30.56■■■□□ 2.48
NFE2L1-206ENST00000577431 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.55■■■□□ 2.48
NFE2L1-206ENST00000577431 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.55■■■□□ 2.48
NFE2L1-206ENST00000577431 OSCARQ8IYS5 282 aa30.49■■■□□ 2.47
NFE2L1-206ENST00000577431 SYNJ2O15056 1496 aa30.49■■■□□ 2.47
NFE2L1-206ENST00000577431 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.47■■■□□ 2.47
NFE2L1-206ENST00000577431 ADAMTS12P58397 1594 aa30.43■■■□□ 2.46
NFE2L1-206ENST00000577431 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.4■■■□□ 2.46
NFE2L1-206ENST00000577431 CHD1O14646 1710 aa30.39■■■□□ 2.46
NFE2L1-206ENST00000577431 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
NFE2L1-206ENST00000577431 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.35■■■□□ 2.45
NFE2L1-206ENST00000577431 EEA1Q15075 1411 aa30.34■■■□□ 2.45
NFE2L1-206ENST00000577431 GRIN2AQ12879 1464 aa30.33■■■□□ 2.45
NFE2L1-206ENST00000577431 CUL7Q14999 1698 aa30.32■■■□□ 2.44
NFE2L1-206ENST00000577431 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.3■■■□□ 2.44
NFE2L1-206ENST00000577431 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.21■■■□□ 2.43
NFE2L1-206ENST00000577431 NUP160Q12769 1436 aa30.19■■■□□ 2.42
NFE2L1-206ENST00000577431 PRXQ9BXM0 1461 aa30.19■■■□□ 2.42
NFE2L1-206ENST00000577431 CEP170Q5SW79 1584 aa30.14■■■□□ 2.42
NFE2L1-206ENST00000577431 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.1■■■□□ 2.41
NFE2L1-206ENST00000577431 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.01■■■□□ 2.4
NFE2L1-206ENST00000577431 JPH4Q96JJ6 628 aa29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms