Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDHB6Q9Y5E3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHB6Q9Y5E3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms