RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264059.7

EFHD1-201, Transcript of EF-hand domain family member D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFHD1, Length 2,259 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1-201ENST00000264059 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.38■■■■■ 4.54
EFHD1-201ENST00000264059 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.98■■■■□ 3.51
EFHD1-201ENST00000264059 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.88■■■■□ 3.49
EFHD1-201ENST00000264059 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
EFHD1-201ENST00000264059 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
EFHD1-201ENST00000264059 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.82■■■■□ 3.32
EFHD1-201ENST00000264059 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.64■■■■□ 3.3
EFHD1-201ENST00000264059 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.44■■■■□ 3.26
EFHD1-201ENST00000264059 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.33■■■■□ 3.25
EFHD1-201ENST00000264059 ABCC9O60706 1549 aa34.7■■■■□ 3.14
EFHD1-201ENST00000264059 HRCP23327 699 aa34.57■■■■□ 3.13
EFHD1-201ENST00000264059 SCRIBQ14160 1630 aa34.52■■■■□ 3.12
EFHD1-201ENST00000264059 PCGF6Q9BYE7 350 aa34.43■■■■□ 3.1
EFHD1-201ENST00000264059 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
EFHD1-201ENST00000264059 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.35■■■■□ 3.09
EFHD1-201ENST00000264059 NACADO15069 1562 aa34.04■■■■□ 3.04
EFHD1-201ENST00000264059 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.04■■■■□ 3.04
EFHD1-201ENST00000264059 TRIM41Q8WV44 630 aa33.88■■■■□ 3.01
EFHD1-201ENST00000264059 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
EFHD1-201ENST00000264059 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.8■■■■□ 3
EFHD1-201ENST00000264059 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
EFHD1-201ENST00000264059 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.71■■■□□ 2.99
EFHD1-201ENST00000264059 WIZO95785 1651 aa33.55■■■□□ 2.96
EFHD1-201ENST00000264059 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.55■■■□□ 2.96
EFHD1-201ENST00000264059 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.39■■■□□ 2.94
EFHD1-201ENST00000264059 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.22■■■□□ 2.91
EFHD1-201ENST00000264059 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
EFHD1-201ENST00000264059 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
EFHD1-201ENST00000264059 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
EFHD1-201ENST00000264059 SMARCA4P51532 1647 aa33.02■■■□□ 2.88
EFHD1-201ENST00000264059 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.96■■■□□ 2.87
EFHD1-201ENST00000264059 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.89■■■□□ 2.86
EFHD1-201ENST00000264059 SMARCA2P51531 1590 aa32.87■■■□□ 2.85
EFHD1-201ENST00000264059 ABCC8Q09428 1581 aa32.83■■■□□ 2.85
EFHD1-201ENST00000264059 SOGA1O94964 1423 aa32.54■■■□□ 2.8
EFHD1-201ENST00000264059 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.53■■■□□ 2.8
EFHD1-201ENST00000264059 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.51■■■□□ 2.79
EFHD1-201ENST00000264059 CEP162Q5TB80 1403 aa32.47■■■□□ 2.79
EFHD1-201ENST00000264059 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.47■■■□□ 2.79
EFHD1-201ENST00000264059 EEA1Q15075 1411 aa32.46■■■□□ 2.79
EFHD1-201ENST00000264059 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.43■■■□□ 2.78
EFHD1-201ENST00000264059 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.41■■■□□ 2.78
EFHD1-201ENST00000264059 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.38■■■□□ 2.77
EFHD1-201ENST00000264059 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.38■■■□□ 2.77
EFHD1-201ENST00000264059 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.37■■■□□ 2.77
EFHD1-201ENST00000264059 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
EFHD1-201ENST00000264059 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
EFHD1-201ENST00000264059 GOLGA3Q08378 1498 aa32.23■■■□□ 2.75
EFHD1-201ENST00000264059 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
EFHD1-201ENST00000264059 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.12■■■□□ 2.73
EFHD1-201ENST00000264059 SYNJ1O43426 1573 aa32.12■■■□□ 2.73
EFHD1-201ENST00000264059 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
EFHD1-201ENST00000264059 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.04■■■□□ 2.72
EFHD1-201ENST00000264059 KIF21BO75037 1637 aa32.02■■■□□ 2.72
EFHD1-201ENST00000264059 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
EFHD1-201ENST00000264059 CLIP1P30622 1438 aa31.85■■■□□ 2.69
EFHD1-201ENST00000264059 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
EFHD1-201ENST00000264059 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.76■■■□□ 2.67
EFHD1-201ENST00000264059 TOP2BQ02880 1626 aa31.74■■■□□ 2.67
EFHD1-201ENST00000264059 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.74■■■□□ 2.67
EFHD1-201ENST00000264059 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.64■■■□□ 2.66
EFHD1-201ENST00000264059 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
EFHD1-201ENST00000264059 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
EFHD1-201ENST00000264059 APLP2Q06481 763 aa31.58■■■□□ 2.65
EFHD1-201ENST00000264059 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
EFHD1-201ENST00000264059 NEUROD1Q13562 356 aa31.51■■■□□ 2.64
EFHD1-201ENST00000264059 HMGXB3Q12766 1538 aa31.51■■■□□ 2.63
EFHD1-201ENST00000264059 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
EFHD1-201ENST00000264059 NCAPD3P42695 1498 aa31.49■■■□□ 2.63
EFHD1-201ENST00000264059 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.49■■■□□ 2.63
EFHD1-201ENST00000264059 PRXQ9BXM0 1461 aa31.46■■■□□ 2.63
EFHD1-201ENST00000264059 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
EFHD1-201ENST00000264059 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
EFHD1-201ENST00000264059 CUX1P39880 1505 aa31.38■■■□□ 2.61
EFHD1-201ENST00000264059 ARAP1Q96P48 1450 aa31.33■■■□□ 2.61
EFHD1-201ENST00000264059 KIF27Q86VH2 1401 aa31.28■■■□□ 2.6
EFHD1-201ENST00000264059 CFTRP13569 1480 aa31.27■■■□□ 2.6
EFHD1-201ENST00000264059 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa31.21■■■□□ 2.59
EFHD1-201ENST00000264059 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
EFHD1-201ENST00000264059 PRDM2Q13029 1718 aa31.07■■■□□ 2.56
EFHD1-201ENST00000264059 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.07■■■□□ 2.56
EFHD1-201ENST00000264059 MIER1Q8N108 512 aa31.05■■■□□ 2.56
EFHD1-201ENST00000264059 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
EFHD1-201ENST00000264059 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.04■■■□□ 2.56
EFHD1-201ENST00000264059 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
EFHD1-201ENST00000264059 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
EFHD1-201ENST00000264059 CUX2O14529 1486 aa30.94■■■□□ 2.54
EFHD1-201ENST00000264059 IGF1RP08069 1367 aa30.91■■■□□ 2.54
EFHD1-201ENST00000264059 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.88■■■□□ 2.53
EFHD1-201ENST00000264059 CCNB3Q8WWL7 1395 aa30.87■■■□□ 2.53
EFHD1-201ENST00000264059 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.81■■■□□ 2.52
EFHD1-201ENST00000264059 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.78■■■□□ 2.52
EFHD1-201ENST00000264059 MAP3K1Q13233 1512 aa30.74■■■□□ 2.51
EFHD1-201ENST00000264059 TIAM1Q13009 1591 aa30.74■■■□□ 2.51
EFHD1-201ENST00000264059 ITGAEP38570 1179 aa30.69■■■□□ 2.5
EFHD1-201ENST00000264059 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa30.62■■■□□ 2.49
EFHD1-201ENST00000264059 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.6■■■□□ 2.49
EFHD1-201ENST00000264059 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa30.6■■■□□ 2.49
EFHD1-201ENST00000264059 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.59■■■□□ 2.49
EFHD1-201ENST00000264059 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms