Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
PCDHB6Q9Y5E3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PCDHB6Q9Y5E3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
PCDHB6Q9Y5E3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
PCDHB6Q9Y5E3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PCDHB6Q9Y5E3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
PCDHB6Q9Y5E3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PCDHB6Q9Y5E3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PCDHB6Q9Y5E3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
PCDHB6Q9Y5E3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
PCDHB6Q9Y5E3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
PCDHB6Q9Y5E3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PCDHB6Q9Y5E3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PCDHB6Q9Y5E3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PCDHB6Q9Y5E3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PCDHB6Q9Y5E3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PCDHB6Q9Y5E3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PCDHB6Q9Y5E3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PCDHB6Q9Y5E3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
PCDHB6Q9Y5E3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PCDHB6Q9Y5E3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PCDHB6Q9Y5E3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PCDHB6Q9Y5E3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PCDHB6Q9Y5E3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PCDHB6Q9Y5E3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PCDHB6Q9Y5E3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PCDHB6Q9Y5E3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PCDHB6Q9Y5E3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PCDHB6Q9Y5E3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PCDHB6Q9Y5E3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PCDHB6Q9Y5E3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PCDHB6Q9Y5E3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PCDHB6Q9Y5E3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PCDHB6Q9Y5E3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PCDHB6Q9Y5E3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PCDHB6Q9Y5E3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PCDHB6Q9Y5E3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PCDHB6Q9Y5E3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PCDHB6Q9Y5E3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PCDHB6Q9Y5E3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PCDHB6Q9Y5E3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCDHB6Q9Y5E3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PCDHB6Q9Y5E3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PCDHB6Q9Y5E3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
PCDHB6Q9Y5E3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
PCDHB6Q9Y5E3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PCDHB6Q9Y5E3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCDHB6Q9Y5E3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCDHB6Q9Y5E3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PCDHB6Q9Y5E3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCDHB6Q9Y5E3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PCDHB6Q9Y5E3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCDHB6Q9Y5E3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCDHB6Q9Y5E3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PCDHB6Q9Y5E3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PCDHB6Q9Y5E3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PCDHB6Q9Y5E3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCDHB6Q9Y5E3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PCDHB6Q9Y5E3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PCDHB6Q9Y5E3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
PCDHB6Q9Y5E3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PCDHB6Q9Y5E3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCDHB6Q9Y5E3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PCDHB6Q9Y5E3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCDHB6Q9Y5E3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PCDHB6Q9Y5E3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PCDHB6Q9Y5E3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PCDHB6Q9Y5E3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PCDHB6Q9Y5E3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PCDHB6Q9Y5E3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PCDHB6Q9Y5E3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PCDHB6Q9Y5E3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PCDHB6Q9Y5E3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PCDHB6Q9Y5E3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PCDHB6Q9Y5E3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCDHB6Q9Y5E3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PCDHB6Q9Y5E3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PCDHB6Q9Y5E3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PCDHB6Q9Y5E3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PCDHB6Q9Y5E3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PCDHB6Q9Y5E3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PCDHB6Q9Y5E3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PCDHB6Q9Y5E3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PCDHB6Q9Y5E3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PCDHB6Q9Y5E3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PCDHB6Q9Y5E3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PCDHB6Q9Y5E3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PCDHB6Q9Y5E3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCDHB6Q9Y5E3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PCDHB6Q9Y5E3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PCDHB6Q9Y5E3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCDHB6Q9Y5E3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCDHB6Q9Y5E3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
PCDHB6Q9Y5E3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms