Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC6LQ2NKX8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC6LQ2NKX8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms