Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ERCC6LQ2NKX8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
ERCC6LQ2NKX8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ERCC6LQ2NKX8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ERCC6LQ2NKX8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ERCC6LQ2NKX8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ERCC6LQ2NKX8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6LQ2NKX8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6LQ2NKX8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
ERCC6LQ2NKX8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
ERCC6LQ2NKX8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
ERCC6LQ2NKX8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ERCC6LQ2NKX8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ERCC6LQ2NKX8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ERCC6LQ2NKX8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ERCC6LQ2NKX8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERCC6LQ2NKX8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ERCC6LQ2NKX8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ERCC6LQ2NKX8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERCC6LQ2NKX8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6LQ2NKX8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERCC6LQ2NKX8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ERCC6LQ2NKX8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6LQ2NKX8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERCC6LQ2NKX8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERCC6LQ2NKX8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERCC6LQ2NKX8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERCC6LQ2NKX8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6LQ2NKX8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ERCC6LQ2NKX8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ERCC6LQ2NKX8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERCC6LQ2NKX8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERCC6LQ2NKX8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6LQ2NKX8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ERCC6LQ2NKX8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ERCC6LQ2NKX8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ERCC6LQ2NKX8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ERCC6LQ2NKX8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
ERCC6LQ2NKX8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6LQ2NKX8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ERCC6LQ2NKX8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ERCC6LQ2NKX8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ERCC6LQ2NKX8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ERCC6LQ2NKX8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ERCC6LQ2NKX8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ERCC6LQ2NKX8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6LQ2NKX8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ERCC6LQ2NKX8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ERCC6LQ2NKX8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
ERCC6LQ2NKX8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ERCC6LQ2NKX8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
ERCC6LQ2NKX8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ERCC6LQ2NKX8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
ERCC6LQ2NKX8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
ERCC6LQ2NKX8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6LQ2NKX8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ERCC6LQ2NKX8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ERCC6LQ2NKX8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
ERCC6LQ2NKX8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ERCC6LQ2NKX8 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ERCC6LQ2NKX8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6LQ2NKX8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ERCC6LQ2NKX8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ERCC6LQ2NKX8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ERCC6LQ2NKX8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ERCC6LQ2NKX8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
ERCC6LQ2NKX8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
ERCC6LQ2NKX8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6LQ2NKX8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6LQ2NKX8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ERCC6LQ2NKX8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ERCC6LQ2NKX8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ERCC6LQ2NKX8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERCC6LQ2NKX8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERCC6LQ2NKX8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ERCC6LQ2NKX8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ERCC6LQ2NKX8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ERCC6LQ2NKX8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ERCC6LQ2NKX8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERCC6LQ2NKX8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ERCC6LQ2NKX8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ERCC6LQ2NKX8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ERCC6LQ2NKX8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ERCC6LQ2NKX8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ERCC6LQ2NKX8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6LQ2NKX8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ERCC6LQ2NKX8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ERCC6LQ2NKX8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ERCC6LQ2NKX8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ERCC6LQ2NKX8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6LQ2NKX8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ERCC6LQ2NKX8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ERCC6LQ2NKX8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ERCC6LQ2NKX8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6LQ2NKX8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
ERCC6LQ2NKX8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ERCC6LQ2NKX8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6LQ2NKX8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6LQ2NKX8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6LQ2NKX8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms