Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 PTK2-254ENST00000524040 475 ntTSL 217.03■□□□□ 0.323e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 PTK2-231ENST00000521332 630 ntTSL 416.86■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.342e-8■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 EHMT1-215ENST00000492232 710 ntTSL 310.93□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 EHMT1-222ENST00000629417 882 ntTSL 310.15□□□□□ -0.784e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 MCPH1-207ENST00000522905 2049 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.612e-12■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 MCPH1-203ENST00000519480 2917 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.852e-12■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.934e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.824e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 TTYH1-215ENST00000487134 2692 ntTSL 1 (best)19.41■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 TTYH1-216ENST00000489425 1240 ntTSL 1 (best)17.43■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 TTYH1-204ENST00000391739 3678 ntTSL 213.3□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 TTYH1-217ENST00000492920 757 ntTSL 211.61□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 PCGF2-207ENST00000620225 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 SGMS1-208ENST00000608287 542 ntTSL 417.98■□□□□ 0.476e-9■■■■■ 37.8
PCBP2Q15366 HNRNPU-217ENST00000638952 5678 ntTSL 516.63■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HNRNPU-228ENST00000640306 2917 ntTSL 516.2■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HNRNPU-209ENST00000476241 4844 ntTSL 515.55■□□□□ 0.081e-8■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11e-8■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HNRNPU-214ENST00000638475 2698 ntTSL 514.3□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HNRNPU-229ENST00000640440 871 ntTSL 313.4□□□□□ -0.261e-8■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 59.78□□□□□ -0.841e-8■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.625e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.425e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.225e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.85□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PQLC1-210ENST00000589452 704 ntTSL 526.84■■□□□ 1.894e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PIAS2-202ENST00000398654 2043 ntTSL 1 (best)24.79■■□□□ 1.564e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 WAC-212ENST00000448193 506 ntTSL 224.68■■□□□ 1.544e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PQLC1-214ENST00000593030 764 ntTSL 523.19■■□□□ 1.34e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 NUP210-202ENST00000420141 3134 ntTSL 1 (best)22.26■■□□□ 1.154e-6■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CLASP1-213ENST00000485112 869 ntTSL 521.74■■□□□ 1.074e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.042e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CENPX-203ENST00000577379 861 ntTSL 521.4■■□□□ 1.022e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.944e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 UHRF1-202ENST00000613817 1859 ntTSL 220.89■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 519.6■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.634e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 WAC-211ENST00000442148 759 ntTSL 518.63■□□□□ 0.574e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CENPX-211ENST00000585091 739 ntTSL 318.04■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.474e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CENPX-209ENST00000584514 882 ntTSL 217.75■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CENPX-205ENST00000580090 752 ntTSL 217.62■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CENPX-207ENST00000583767 894 ntTSL 317.41■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 AC024592.3-201ENST00000592091 2118 ntTSL 217.41■□□□□ 0.384e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.354e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 GDE1-203ENST00000564172 2238 ntTSL 1 (best)17.21■□□□□ 0.354e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.314e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 VPS37A-203ENST00000518038 655 ntTSL 316.65■□□□□ 0.264e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PRRG1-206ENST00000484460 582 ntTSL 416.2■□□□□ 0.184e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.184e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CENPX-204ENST00000579520 702 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.164e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 AC024592.3-203ENST00000585661 431 ntAPPRIS P1 TSL 215.7■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CENPX-210ENST00000584600 730 ntTSL 215.21■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 SENP2-202ENST00000413407 2383 ntTSL 215.18■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PRRG1-204ENST00000466533 628 ntTSL 315.15■□□□□ 0.024e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 VPS37A-204ENST00000519381 575 ntTSL 414.54□□□□□ -0.084e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PTOV1-208ENST00000597730 327 ntTSL 214.41□□□□□ -0.14e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HPS1-205ENST00000414009 857 ntTSL 214.07□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HPS1-214ENST00000498219 845 ntTSL 513.96□□□□□ -0.174e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HPS1-209ENST00000470095 801 ntTSL 513.85□□□□□ -0.194e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 WAC-220ENST00000532233 543 ntTSL 413.8□□□□□ -0.24e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 VPS37A-206ENST00000520140 2102 ntTSL 513.7□□□□□ -0.224e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 WAC-218ENST00000528491 507 ntTSL 413.5□□□□□ -0.254e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 WAC-217ENST00000526722 585 ntTSL 413.5□□□□□ -0.254e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.264e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 WAC-207ENST00000420266 784 ntTSL 513.11□□□□□ -0.314e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.324e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HPS1-201ENST00000325103 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.394e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 WAC-204ENST00000375646 2176 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.444e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HPS1-211ENST00000478087 971 ntTSL 512.1□□□□□ -0.474e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HPS1-203ENST00000359632 978 ntTSL 312.1□□□□□ -0.474e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-224ENST00000568502 546 ntTSL 411.66□□□□□ -0.544e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HPS1-204ENST00000361490 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.64e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 HPS1-208ENST00000467246 2791 ntTSL 1 (best)11.26□□□□□ -0.614e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-211ENST00000563845 528 ntTSL 411.25□□□□□ -0.614e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 UHRF1-207ENST00000624301 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PTOV1-216ENST00000601093 522 ntTSL 211.04□□□□□ -0.644e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PRRG1-209ENST00000543642 4509 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.694e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 KLHDC4-206ENST00000561825 562 ntTSL 510.68□□□□□ -0.74e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 UHRF1-201ENST00000612630 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 VPS37A-210ENST00000521829 1307 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.774e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 VPS37A-202ENST00000425020 4051 ntTSL 210.07□□□□□ -0.84e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 GDE1-205ENST00000569899 1618 ntTSL 49.72□□□□□ -0.854e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 ATP5I-202ENST00000505852 300 ntTSL 29.23□□□□□ -0.934e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PRRG1-207ENST00000491253 650 ntTSL 39.17□□□□□ -0.944e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 AF241726.2-201ENST00000465127 954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.944e-9■■■■■ 37.7
PCBP2Q15366 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.974e-9■■■■■ 37.7
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 434.5 ms