RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498219.5

HPS1-214, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-214ENST00000498219 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.87■■■■□ 3.33
HPS1-214ENST00000498219 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.9■■■□□ 2.7
HPS1-214ENST00000498219 ABCC9O60706 1549 aa31.38■■■□□ 2.61
HPS1-214ENST00000498219 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.1■■■□□ 2.41
HPS1-214ENST00000498219 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.07■■■□□ 2.4
HPS1-214ENST00000498219 NACADO15069 1562 aa29.98■■■□□ 2.39
HPS1-214ENST00000498219 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
HPS1-214ENST00000498219 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.71■■■□□ 2.35
HPS1-214ENST00000498219 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.59■■■□□ 2.33
HPS1-214ENST00000498219 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.52■■■□□ 2.32
HPS1-214ENST00000498219 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.29
HPS1-214ENST00000498219 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.22■■■□□ 2.27
HPS1-214ENST00000498219 SCRIBQ14160 1630 aa29.21■■■□□ 2.27
HPS1-214ENST00000498219 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.89■■■□□ 2.22
HPS1-214ENST00000498219 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.73■■■□□ 2.19
HPS1-214ENST00000498219 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
HPS1-214ENST00000498219 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.36■■■□□ 2.13
HPS1-214ENST00000498219 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.15■■■□□ 2.1
HPS1-214ENST00000498219 SMARCA4P51532 1647 aa27.88■■■□□ 2.05
HPS1-214ENST00000498219 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
HPS1-214ENST00000498219 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.71■■■□□ 2.03
HPS1-214ENST00000498219 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.69■■■□□ 2.02
HPS1-214ENST00000498219 NCAPD3P42695 1498 aa27.66■■■□□ 2.02
HPS1-214ENST00000498219 SMARCA2P51531 1590 aa27.65■■■□□ 2.02
HPS1-214ENST00000498219 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.53■■■□□ 2
HPS1-214ENST00000498219 HMGXB3Q12766 1538 aa27.53■■■□□ 2
HPS1-214ENST00000498219 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
HPS1-214ENST00000498219 WIZO95785 1651 aa27.43■■□□□ 1.98
HPS1-214ENST00000498219 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
HPS1-214ENST00000498219 NESP48681 1621 aa27.16■■□□□ 1.94
HPS1-214ENST00000498219 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
HPS1-214ENST00000498219 ERCC6Q03468 1493 aa27.01■■□□□ 1.91
HPS1-214ENST00000498219 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.97■■□□□ 1.91
HPS1-214ENST00000498219 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.88■■□□□ 1.89
HPS1-214ENST00000498219 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.85■■□□□ 1.89
HPS1-214ENST00000498219 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.77■■□□□ 1.88
HPS1-214ENST00000498219 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.76■■□□□ 1.87
HPS1-214ENST00000498219 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
HPS1-214ENST00000498219 CFTRP13569 1480 aa26.7■■□□□ 1.87
HPS1-214ENST00000498219 CUX2O14529 1486 aa26.68■■□□□ 1.86
HPS1-214ENST00000498219 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
HPS1-214ENST00000498219 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.6■■□□□ 1.85
HPS1-214ENST00000498219 PRDM2Q13029 1718 aa26.56■■□□□ 1.84
HPS1-214ENST00000498219 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.56■■□□□ 1.84
HPS1-214ENST00000498219 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.55■■□□□ 1.84
HPS1-214ENST00000498219 WDR62O43379 1518 aa26.45■■□□□ 1.83
HPS1-214ENST00000498219 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HPS1-214ENST00000498219 TOPBP1Q92547 1522 aa26.18■■□□□ 1.78
HPS1-214ENST00000498219 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.13■■□□□ 1.77
HPS1-214ENST00000498219 ABCC8Q09428 1581 aa26.07■■□□□ 1.76
HPS1-214ENST00000498219 IFT140Q96RY7 1462 aa25.99■■□□□ 1.75
HPS1-214ENST00000498219 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.99■■□□□ 1.75
HPS1-214ENST00000498219 CUX1P39880 1505 aa25.98■■□□□ 1.75
HPS1-214ENST00000498219 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
HPS1-214ENST00000498219 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
HPS1-214ENST00000498219 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
HPS1-214ENST00000498219 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.9■■□□□ 1.74
HPS1-214ENST00000498219 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.89■■□□□ 1.73
HPS1-214ENST00000498219 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
HPS1-214ENST00000498219 SOGA1O94964 1423 aa25.83■■□□□ 1.73
HPS1-214ENST00000498219 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.727e-7■■■■■ 30.1
HPS1-214ENST00000498219 SYNJ1O43426 1573 aa25.75■■□□□ 1.71
HPS1-214ENST00000498219 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
HPS1-214ENST00000498219 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
HPS1-214ENST00000498219 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.72■■□□□ 1.71
HPS1-214ENST00000498219 TOP2BQ02880 1626 aa25.7■■□□□ 1.71
HPS1-214ENST00000498219 WDR97A6NE52 1622 aa25.7■■□□□ 1.7
HPS1-214ENST00000498219 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.59■■□□□ 1.69
HPS1-214ENST00000498219 OSCARQ8IYS5 282 aa25.59■■□□□ 1.69
HPS1-214ENST00000498219 CHD1O14646 1710 aa25.58■■□□□ 1.69
HPS1-214ENST00000498219 PBRM1Q86U86 1689 aa25.55■■□□□ 1.68
HPS1-214ENST00000498219 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.54■■□□□ 1.68
HPS1-214ENST00000498219 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.53■■□□□ 1.68
HPS1-214ENST00000498219 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.53■■□□□ 1.68
HPS1-214ENST00000498219 FBLN2P98095 1184 aa25.52■■□□□ 1.68
HPS1-214ENST00000498219 GRIN2BQ13224 1484 aa25.52■■□□□ 1.68
HPS1-214ENST00000498219 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
HPS1-214ENST00000498219 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HPS1-214ENST00000498219 SYNJ2O15056 1496 aa25.36■■□□□ 1.65
HPS1-214ENST00000498219 ADAMTS12P58397 1594 aa25.3■■□□□ 1.64
HPS1-214ENST00000498219 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.27■■□□□ 1.64
HPS1-214ENST00000498219 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.27■■□□□ 1.64
HPS1-214ENST00000498219 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.27■■□□□ 1.64
HPS1-214ENST00000498219 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.27■■□□□ 1.64
HPS1-214ENST00000498219 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.22■■□□□ 1.63
HPS1-214ENST00000498219 ARHGEF11O15085 1522 aa25.22■■□□□ 1.63
HPS1-214ENST00000498219 TRIM41Q8WV44 630 aa25.21■■□□□ 1.63
HPS1-214ENST00000498219 GRIN2AQ12879 1464 aa25.21■■□□□ 1.63
HPS1-214ENST00000498219 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.2■■□□□ 1.63
HPS1-214ENST00000498219 KIF27Q86VH2 1401 aa25.19■■□□□ 1.62
HPS1-214ENST00000498219 CEP170Q5SW79 1584 aa25.13■■□□□ 1.61
HPS1-214ENST00000498219 IGF1RP08069 1367 aa25.12■■□□□ 1.61
HPS1-214ENST00000498219 NUP160Q12769 1436 aa25.08■■□□□ 1.61
HPS1-214ENST00000498219 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.07■■□□□ 1.6
HPS1-214ENST00000498219 CUL7Q14999 1698 aa25.05■■□□□ 1.6
HPS1-214ENST00000498219 ARAP1Q96P48 1450 aa25.02■■□□□ 1.6
HPS1-214ENST00000498219 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.01■■□□□ 1.59
HPS1-214ENST00000498219 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.97■■□□□ 1.59
HPS1-214ENST00000498219 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.96■■□□□ 1.59
HPS1-214ENST00000498219 SHROOM2Q13796 1616 aa24.92■■□□□ 1.58
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