RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470095.5

HPS1-209, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-209ENST00000470095 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.35■■■□□ 2.93
HPS1-209ENST00000470095 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.34■■■□□ 2.29
HPS1-209ENST00000470095 ABCC9O60706 1549 aa27.98■■■□□ 2.07
HPS1-209ENST00000470095 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
HPS1-209ENST00000470095 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.62■■■□□ 2.01
HPS1-209ENST00000470095 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.46■■□□□ 1.99
HPS1-209ENST00000470095 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.45■■□□□ 1.98
HPS1-209ENST00000470095 NACADO15069 1562 aa27.38■■□□□ 1.97
HPS1-209ENST00000470095 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.22■■□□□ 1.95
HPS1-209ENST00000470095 SCRIBQ14160 1630 aa26.84■■□□□ 1.89
HPS1-209ENST00000470095 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.79■■□□□ 1.88
HPS1-209ENST00000470095 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.71■■□□□ 1.87
HPS1-209ENST00000470095 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.46■■□□□ 1.83
HPS1-209ENST00000470095 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
HPS1-209ENST00000470095 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.92■■□□□ 1.74
HPS1-209ENST00000470095 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
HPS1-209ENST00000470095 SMARCA4P51532 1647 aa25.74■■□□□ 1.71
HPS1-209ENST00000470095 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.74■■□□□ 1.71
HPS1-209ENST00000470095 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
HPS1-209ENST00000470095 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HPS1-209ENST00000470095 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
HPS1-209ENST00000470095 WIZO95785 1651 aa25.51■■□□□ 1.67
HPS1-209ENST00000470095 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.48■■□□□ 1.67
HPS1-209ENST00000470095 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.39■■□□□ 1.65
HPS1-209ENST00000470095 SMARCA2P51531 1590 aa25.39■■□□□ 1.65
HPS1-209ENST00000470095 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.37■■□□□ 1.65
HPS1-209ENST00000470095 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HPS1-209ENST00000470095 NCAPD3P42695 1498 aa25.25■■□□□ 1.63
HPS1-209ENST00000470095 HMGXB3Q12766 1538 aa25.22■■□□□ 1.63
HPS1-209ENST00000470095 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HPS1-209ENST00000470095 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.03■■□□□ 1.6
HPS1-209ENST00000470095 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.95■■□□□ 1.58
HPS1-209ENST00000470095 CFTRP13569 1480 aa24.58■■□□□ 1.52
HPS1-209ENST00000470095 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.54■■□□□ 1.52
HPS1-209ENST00000470095 PRDM2Q13029 1718 aa24.49■■□□□ 1.51
HPS1-209ENST00000470095 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.47■■□□□ 1.51
HPS1-209ENST00000470095 NESP48681 1621 aa24.46■■□□□ 1.51
HPS1-209ENST00000470095 ABCC8Q09428 1581 aa24.29■■□□□ 1.48
HPS1-209ENST00000470095 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.29■■□□□ 1.48
HPS1-209ENST00000470095 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.28■■□□□ 1.48
HPS1-209ENST00000470095 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.23■■□□□ 1.47
HPS1-209ENST00000470095 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.21■■□□□ 1.47
HPS1-209ENST00000470095 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
HPS1-209ENST00000470095 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.17■■□□□ 1.46
HPS1-209ENST00000470095 SYNJ1O43426 1573 aa24.14■■□□□ 1.45
HPS1-209ENST00000470095 CUX1P39880 1505 aa24.11■■□□□ 1.45
HPS1-209ENST00000470095 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.09■■□□□ 1.45
HPS1-209ENST00000470095 TOP2BQ02880 1626 aa24.08■■□□□ 1.45
HPS1-209ENST00000470095 TRIM41Q8WV44 630 aa24.04■■□□□ 1.44
HPS1-209ENST00000470095 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
HPS1-209ENST00000470095 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.03■■□□□ 1.44
HPS1-209ENST00000470095 ERCC6Q03468 1493 aa24.02■■□□□ 1.44
HPS1-209ENST00000470095 MRC2Q9UBG0 1479 aa24■■□□□ 1.43
HPS1-209ENST00000470095 TOPBP1Q92547 1522 aa24■■□□□ 1.43
HPS1-209ENST00000470095 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
HPS1-209ENST00000470095 WDR62O43379 1518 aa23.92■■□□□ 1.42
HPS1-209ENST00000470095 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.89■■□□□ 1.42
HPS1-209ENST00000470095 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HPS1-209ENST00000470095 CUX2O14529 1486 aa23.73■■□□□ 1.39
HPS1-209ENST00000470095 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.73■■□□□ 1.39
HPS1-209ENST00000470095 SOGA1O94964 1423 aa23.72■■□□□ 1.39
HPS1-209ENST00000470095 WDR97A6NE52 1622 aa23.72■■□□□ 1.39
HPS1-209ENST00000470095 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
HPS1-209ENST00000470095 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.69■■□□□ 1.38
HPS1-209ENST00000470095 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.68■■□□□ 1.38
HPS1-209ENST00000470095 IFT140Q96RY7 1462 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS1-209ENST00000470095 EEA1Q15075 1411 aa23.63■■□□□ 1.37
HPS1-209ENST00000470095 KIF27Q86VH2 1401 aa23.59■■□□□ 1.37
HPS1-209ENST00000470095 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HPS1-209ENST00000470095 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.56■■□□□ 1.36
HPS1-209ENST00000470095 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HPS1-209ENST00000470095 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HPS1-209ENST00000470095 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.47■■□□□ 1.35
HPS1-209ENST00000470095 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.46■■□□□ 1.35
HPS1-209ENST00000470095 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HPS1-209ENST00000470095 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.43■■□□□ 1.343e-7■■■■■ 32.1
HPS1-209ENST00000470095 IGF1RP08069 1367 aa23.42■■□□□ 1.34
HPS1-209ENST00000470095 PBRM1Q86U86 1689 aa23.42■■□□□ 1.34
HPS1-209ENST00000470095 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.4■■□□□ 1.34
HPS1-209ENST00000470095 KIF21BO75037 1637 aa23.39■■□□□ 1.33
HPS1-209ENST00000470095 PRXQ9BXM0 1461 aa23.37■■□□□ 1.33
HPS1-209ENST00000470095 GRIN2BQ13224 1484 aa23.36■■□□□ 1.33
HPS1-209ENST00000470095 CUL7Q14999 1698 aa23.35■■□□□ 1.33
HPS1-209ENST00000470095 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.29■■□□□ 1.32
HPS1-209ENST00000470095 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.29■■□□□ 1.32
HPS1-209ENST00000470095 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.29■■□□□ 1.32
HPS1-209ENST00000470095 ADAMTS12P58397 1594 aa23.28■■□□□ 1.32
HPS1-209ENST00000470095 GOLGA3Q08378 1498 aa23.28■■□□□ 1.32
HPS1-209ENST00000470095 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.25■■□□□ 1.31
HPS1-209ENST00000470095 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HPS1-209ENST00000470095 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.22■■□□□ 1.31
HPS1-209ENST00000470095 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.2■■□□□ 1.3
HPS1-209ENST00000470095 SYNJ2O15056 1496 aa23.12■■□□□ 1.29
HPS1-209ENST00000470095 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.11■■□□□ 1.29
HPS1-209ENST00000470095 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.1■■□□□ 1.29
HPS1-209ENST00000470095 GRIN2AQ12879 1464 aa23.08■■□□□ 1.29
HPS1-209ENST00000470095 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HPS1-209ENST00000470095 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS1-209ENST00000470095 CHD1O14646 1710 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS1-209ENST00000470095 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms