RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325103.10

HPS1-201, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-201ENST00000325103 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.05■■□□□ 1.92
HPS1-201ENST00000325103 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.01■■□□□ 1.43
HPS1-201ENST00000325103 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.59■■□□□ 1.37
HPS1-201ENST00000325103 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
HPS1-201ENST00000325103 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS1-201ENST00000325103 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
HPS1-201ENST00000325103 ABCC9O60706 1549 aa22.56■■□□□ 1.2
HPS1-201ENST00000325103 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa21.91■■□□□ 1.1
HPS1-201ENST00000325103 SCRIBQ14160 1630 aa21.9■■□□□ 1.1
HPS1-201ENST00000325103 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
HPS1-201ENST00000325103 NACADO15069 1562 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS1-201ENST00000325103 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.62■■□□□ 1.05
HPS1-201ENST00000325103 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.58■■□□□ 1.05
HPS1-201ENST00000325103 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.5■■□□□ 1.03
HPS1-201ENST00000325103 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HPS1-201ENST00000325103 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.47■■□□□ 1.03
HPS1-201ENST00000325103 TRIM41Q8WV44 630 aa21.35■■□□□ 1.01
HPS1-201ENST00000325103 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.33■■□□□ 1
HPS1-201ENST00000325103 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
HPS1-201ENST00000325103 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.22■□□□□ 0.99
HPS1-201ENST00000325103 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.08■□□□□ 0.97
HPS1-201ENST00000325103 WIZO95785 1651 aa20.87■□□□□ 0.93
HPS1-201ENST00000325103 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
HPS1-201ENST00000325103 PCGF6Q9BYE7 350 aa20.84■□□□□ 0.93
HPS1-201ENST00000325103 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.78■□□□□ 0.92
HPS1-201ENST00000325103 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.74■□□□□ 0.91
HPS1-201ENST00000325103 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
HPS1-201ENST00000325103 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
HPS1-201ENST00000325103 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
HPS1-201ENST00000325103 SMARCA4P51532 1647 aa20.66■□□□□ 0.9
HPS1-201ENST00000325103 UBTFP17480 764 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
HPS1-201ENST00000325103 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.55■□□□□ 0.88
HPS1-201ENST00000325103 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HPS1-201ENST00000325103 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HPS1-201ENST00000325103 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.45■□□□□ 0.86
HPS1-201ENST00000325103 ABCC8Q09428 1581 aa20.4■□□□□ 0.86
HPS1-201ENST00000325103 SMARCA2P51531 1590 aa20.33■□□□□ 0.85
HPS1-201ENST00000325103 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.29■□□□□ 0.84
HPS1-201ENST00000325103 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HPS1-201ENST00000325103 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HPS1-201ENST00000325103 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.22■□□□□ 0.83
HPS1-201ENST00000325103 SOGA1O94964 1423 aa20.2■□□□□ 0.82
HPS1-201ENST00000325103 APLP2Q06481 763 aa20.18■□□□□ 0.82
HPS1-201ENST00000325103 NCAPD3P42695 1498 aa20.1■□□□□ 0.81
HPS1-201ENST00000325103 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.06■□□□□ 0.8
HPS1-201ENST00000325103 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.05■□□□□ 0.8
HPS1-201ENST00000325103 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HPS1-201ENST00000325103 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.05■□□□□ 0.8
HPS1-201ENST00000325103 HRCP23327 699 aa20.03■□□□□ 0.8
HPS1-201ENST00000325103 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.96■□□□□ 0.79
HPS1-201ENST00000325103 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
HPS1-201ENST00000325103 HMGXB3Q12766 1538 aa19.88■□□□□ 0.77
HPS1-201ENST00000325103 CEP162Q5TB80 1403 aa19.87■□□□□ 0.77
HPS1-201ENST00000325103 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.87■□□□□ 0.77
HPS1-201ENST00000325103 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
HPS1-201ENST00000325103 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
HPS1-201ENST00000325103 P3H3Q8IVL6 736 aa19.84■□□□□ 0.77
HPS1-201ENST00000325103 EEA1Q15075 1411 aa19.83■□□□□ 0.76
HPS1-201ENST00000325103 SYNJ1O43426 1573 aa19.82■□□□□ 0.76
HPS1-201ENST00000325103 GOLGA3Q08378 1498 aa19.8■□□□□ 0.76
HPS1-201ENST00000325103 TNIKQ9UKE5 1360 aa19.77■□□□□ 0.76
HPS1-201ENST00000325103 CFTRP13569 1480 aa19.77■□□□□ 0.75
HPS1-201ENST00000325103 NESP48681 1621 aa19.76■□□□□ 0.75
HPS1-201ENST00000325103 ITGAEP38570 1179 aa19.74■□□□□ 0.75
HPS1-201ENST00000325103 CLIP1P30622 1438 aa19.73■□□□□ 0.75
HPS1-201ENST00000325103 CEP164Q9UPV0 1460 aa19.72■□□□□ 0.75
HPS1-201ENST00000325103 KIF27Q86VH2 1401 aa19.7■□□□□ 0.74
HPS1-201ENST00000325103 CUX2O14529 1486 aa19.68■□□□□ 0.74
HPS1-201ENST00000325103 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.66■□□□□ 0.74
HPS1-201ENST00000325103 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.65■□□□□ 0.74
HPS1-201ENST00000325103 CUX1P39880 1505 aa19.62■□□□□ 0.73
HPS1-201ENST00000325103 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
HPS1-201ENST00000325103 FBLN2P98095 1184 aa19.58■□□□□ 0.73
HPS1-201ENST00000325103 TOP2BQ02880 1626 aa19.55■□□□□ 0.72
HPS1-201ENST00000325103 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
HPS1-201ENST00000325103 ARID3CA6NKF2 412 aa19.53■□□□□ 0.72
HPS1-201ENST00000325103 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.51■□□□□ 0.71
HPS1-201ENST00000325103 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.51■□□□□ 0.71
HPS1-201ENST00000325103 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.51■□□□□ 0.71
HPS1-201ENST00000325103 PDS5BQ9NTI5 1447 aa19.49■□□□□ 0.71
HPS1-201ENST00000325103 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP19.42■□□□□ 0.7
HPS1-201ENST00000325103 IGF1RP08069 1367 aa19.42■□□□□ 0.7
HPS1-201ENST00000325103 ERCC6Q03468 1493 aa19.37■□□□□ 0.69
HPS1-201ENST00000325103 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
HPS1-201ENST00000325103 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.37■□□□□ 0.69
HPS1-201ENST00000325103 TOPBP1Q92547 1522 aa19.35■□□□□ 0.69
HPS1-201ENST00000325103 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.35■□□□□ 0.69
HPS1-201ENST00000325103 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
HPS1-201ENST00000325103 KIF21BO75037 1637 aa19.3■□□□□ 0.68
HPS1-201ENST00000325103 PRXQ9BXM0 1461 aa19.3■□□□□ 0.68
HPS1-201ENST00000325103 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
HPS1-201ENST00000325103 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.26■□□□□ 0.67
HPS1-201ENST00000325103 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
HPS1-201ENST00000325103 DNMBPQ6XZF7 1577 aa19.23■□□□□ 0.67
HPS1-201ENST00000325103 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP19.2■□□□□ 0.667e-7■■■■■ 30.1
HPS1-201ENST00000325103 FHOD3Q2V2M9 1422 aa19.18■□□□□ 0.66
HPS1-201ENST00000325103 ARAP1Q96P48 1450 aa19.17■□□□□ 0.66
HPS1-201ENST00000325103 GAPVD1Q14C86 1478 aa19.15■□□□□ 0.66
HPS1-201ENST00000325103 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.14■□□□□ 0.65
HPS1-201ENST00000325103 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.11■□□□□ 0.65
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