RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613817.4

UHRF1-202, Transcript of ubiquitin like with PHD and ring finger domains 1, humanhuman

TSL 2

Gene UHRF1, Length 1,859 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1-202ENST00000613817 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.83■■■■■ 5.25
UHRF1-202ENST00000613817 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.58■■■■■ 4.25
UHRF1-202ENST00000613817 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
UHRF1-202ENST00000613817 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.68■■■■□ 3.94
UHRF1-202ENST00000613817 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.51■■■■□ 3.91
UHRF1-202ENST00000613817 ABCC9O60706 1549 aa39.37■■■■□ 3.89
UHRF1-202ENST00000613817 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.19■■■■□ 3.86
UHRF1-202ENST00000613817 MYO15BQ96JP2 1530 aa39■■■■□ 3.83
UHRF1-202ENST00000613817 NACADO15069 1562 aa38.77■■■■□ 3.8
UHRF1-202ENST00000613817 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.43■■■■□ 3.74
UHRF1-202ENST00000613817 SCRIBQ14160 1630 aa38.33■■■■□ 3.73
UHRF1-202ENST00000613817 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
UHRF1-202ENST00000613817 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.58■■■■□ 3.61
UHRF1-202ENST00000613817 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.23■■■■□ 3.55
UHRF1-202ENST00000613817 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.21■■■■□ 3.55
UHRF1-202ENST00000613817 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.18■■■■□ 3.54
UHRF1-202ENST00000613817 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.16■■■■□ 3.54
UHRF1-202ENST00000613817 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.96■■■■□ 3.51
UHRF1-202ENST00000613817 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
UHRF1-202ENST00000613817 SMARCA4P51532 1647 aa36.72■■■■□ 3.47
UHRF1-202ENST00000613817 WIZO95785 1651 aa36.65■■■■□ 3.46
UHRF1-202ENST00000613817 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
UHRF1-202ENST00000613817 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.25■■■■□ 3.39
UHRF1-202ENST00000613817 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.18■■■■□ 3.38
UHRF1-202ENST00000613817 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.14■■■■□ 3.38
UHRF1-202ENST00000613817 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
UHRF1-202ENST00000613817 SMARCA2P51531 1590 aa36.11■■■■□ 3.37
UHRF1-202ENST00000613817 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
UHRF1-202ENST00000613817 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.94■■■■□ 3.34
UHRF1-202ENST00000613817 NCAPD3P42695 1498 aa35.81■■■■□ 3.32
UHRF1-202ENST00000613817 HMGXB3Q12766 1538 aa35.72■■■■□ 3.31
UHRF1-202ENST00000613817 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.59■■■■□ 3.29
UHRF1-202ENST00000613817 TRIM41Q8WV44 630 aa35.54■■■■□ 3.28
UHRF1-202ENST00000613817 ABCC8Q09428 1581 aa35.21■■■■□ 3.23
UHRF1-202ENST00000613817 CFTRP13569 1480 aa35.04■■■■□ 3.2
UHRF1-202ENST00000613817 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35■■■■□ 3.19
UHRF1-202ENST00000613817 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.94■■■■□ 3.18
UHRF1-202ENST00000613817 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.89■■■■□ 3.18
UHRF1-202ENST00000613817 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.84■■■■□ 3.17
UHRF1-202ENST00000613817 SYNJ1O43426 1573 aa34.8■■■■□ 3.16
UHRF1-202ENST00000613817 PRDM2Q13029 1718 aa34.76■■■■□ 3.16
UHRF1-202ENST00000613817 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.73■■■■□ 3.15
UHRF1-202ENST00000613817 TOP2BQ02880 1626 aa34.65■■■■□ 3.14
UHRF1-202ENST00000613817 SOGA1O94964 1423 aa34.6■■■■□ 3.13
UHRF1-202ENST00000613817 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.58■■■■□ 3.13
UHRF1-202ENST00000613817 NESP48681 1621 aa34.57■■■■□ 3.13
UHRF1-202ENST00000613817 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.55■■■■□ 3.12
UHRF1-202ENST00000613817 CUX1P39880 1505 aa34.54■■■■□ 3.12
UHRF1-202ENST00000613817 EEA1Q15075 1411 aa34.53■■■■□ 3.12
UHRF1-202ENST00000613817 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.53■■■■□ 3.12
UHRF1-202ENST00000613817 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.45■■■■□ 3.1
UHRF1-202ENST00000613817 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.43■■■■□ 3.1
UHRF1-202ENST00000613817 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.41■■■■□ 3.1
UHRF1-202ENST00000613817 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.35■■■■□ 3.09
UHRF1-202ENST00000613817 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.3■■■■□ 3.08
UHRF1-202ENST00000613817 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.2■■■■□ 3.06
UHRF1-202ENST00000613817 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.17■■■■□ 3.06
UHRF1-202ENST00000613817 TOPBP1Q92547 1522 aa34.15■■■■□ 3.06
UHRF1-202ENST00000613817 KIF27Q86VH2 1401 aa34.12■■■■□ 3.05
UHRF1-202ENST00000613817 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.1■■■■□ 3.05
UHRF1-202ENST00000613817 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.04
UHRF1-202ENST00000613817 GOLGA3Q08378 1498 aa34.06■■■■□ 3.04
UHRF1-202ENST00000613817 KIF21BO75037 1637 aa34.03■■■■□ 3.04
UHRF1-202ENST00000613817 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
UHRF1-202ENST00000613817 CUX2O14529 1486 aa34■■■■□ 3.03
UHRF1-202ENST00000613817 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34■■■■□ 3.03
UHRF1-202ENST00000613817 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.99■■■■□ 3.03
UHRF1-202ENST00000613817 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.91■■■■□ 3.02
UHRF1-202ENST00000613817 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.87■■■■□ 3.01
UHRF1-202ENST00000613817 PRXQ9BXM0 1461 aa33.87■■■■□ 3.01
UHRF1-202ENST00000613817 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.87■■■■□ 3.01
UHRF1-202ENST00000613817 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.86■■■■□ 3.01
UHRF1-202ENST00000613817 CEP162Q5TB80 1403 aa33.81■■■■□ 3
UHRF1-202ENST00000613817 IGF1RP08069 1367 aa33.81■■■■□ 3
UHRF1-202ENST00000613817 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.8■■■■□ 3
UHRF1-202ENST00000613817 ERCC6Q03468 1493 aa33.77■■■■□ 3
UHRF1-202ENST00000613817 WDR97A6NE52 1622 aa33.66■■■□□ 2.98
UHRF1-202ENST00000613817 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.65■■■□□ 2.98
UHRF1-202ENST00000613817 WDR62O43379 1518 aa33.65■■■□□ 2.98
UHRF1-202ENST00000613817 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
UHRF1-202ENST00000613817 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
UHRF1-202ENST00000613817 CLIP1P30622 1438 aa33.54■■■□□ 2.96
UHRF1-202ENST00000613817 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.54■■■□□ 2.96
UHRF1-202ENST00000613817 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.54■■■□□ 2.96
UHRF1-202ENST00000613817 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
UHRF1-202ENST00000613817 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
UHRF1-202ENST00000613817 IFT140Q96RY7 1462 aa33.47■■■□□ 2.95
UHRF1-202ENST00000613817 CUL7Q14999 1698 aa33.46■■■□□ 2.95
UHRF1-202ENST00000613817 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.37■■■□□ 2.934e-7■■■■■ 31.1
UHRF1-202ENST00000613817 PCGF6Q9BYE7 350 aa33.35■■■□□ 2.93
UHRF1-202ENST00000613817 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
UHRF1-202ENST00000613817 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
UHRF1-202ENST00000613817 PBRM1Q86U86 1689 aa33.26■■■□□ 2.92
UHRF1-202ENST00000613817 GRIN2BQ13224 1484 aa33.25■■■□□ 2.91
UHRF1-202ENST00000613817 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.24■■■□□ 2.91
UHRF1-202ENST00000613817 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
UHRF1-202ENST00000613817 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.18■■■□□ 2.9
UHRF1-202ENST00000613817 ARAP1Q96P48 1450 aa33.15■■■□□ 2.9
UHRF1-202ENST00000613817 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.15■■■□□ 2.9
UHRF1-202ENST00000613817 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
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