RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414009.1

HPS1-205, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 2

Gene HPS1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-205ENST00000414009 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
HPS1-205ENST00000414009 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.38■■■■□ 3.41
HPS1-205ENST00000414009 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.17■■■■□ 3.22
HPS1-205ENST00000414009 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
HPS1-205ENST00000414009 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
HPS1-205ENST00000414009 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.21■■■□□ 2.59
HPS1-205ENST00000414009 ABCC9O60706 1549 aa30.36■■■□□ 2.45
HPS1-205ENST00000414009 FOXD1Q16676 465 aa30.24■■■□□ 2.43
HPS1-205ENST00000414009 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.45■■■□□ 2.31
HPS1-205ENST00000414009 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
HPS1-205ENST00000414009 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.32■■■□□ 2.28
HPS1-205ENST00000414009 NACADO15069 1562 aa29.31■■■□□ 2.28
HPS1-205ENST00000414009 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.16■■■□□ 2.26
HPS1-205ENST00000414009 PLPPR3Q6T4P5 718 aa29.12■■■□□ 2.25
HPS1-205ENST00000414009 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.11■■■□□ 2.25
HPS1-205ENST00000414009 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.58■■■□□ 2.17
HPS1-205ENST00000414009 SCRIBQ14160 1630 aa28.5■■■□□ 2.15
HPS1-205ENST00000414009 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.47■■■□□ 2.15
HPS1-205ENST00000414009 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
HPS1-205ENST00000414009 ADRA2BP18089 450 aa28.36■■■□□ 2.13
HPS1-205ENST00000414009 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.32■■■□□ 2.12
HPS1-205ENST00000414009 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
HPS1-205ENST00000414009 MSH5O43196 834 aa28.15■■■□□ 2.1
HPS1-205ENST00000414009 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.13■■■□□ 2.09
HPS1-205ENST00000414009 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
HPS1-205ENST00000414009 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.6■■■□□ 2.01
HPS1-205ENST00000414009 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.45■■□□□ 1.99
HPS1-205ENST00000414009 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.35■■□□□ 1.97
HPS1-205ENST00000414009 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HPS1-205ENST00000414009 SMARCA4P51532 1647 aa27.27■■□□□ 1.96
HPS1-205ENST00000414009 POTEDQ86YR6 584 aa27.17■■□□□ 1.94
HPS1-205ENST00000414009 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.09■■□□□ 1.93
HPS1-205ENST00000414009 SMARCA2P51531 1590 aa27.09■■□□□ 1.93
HPS1-205ENST00000414009 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.06■■□□□ 1.92
HPS1-205ENST00000414009 NCAPD3P42695 1498 aa27.01■■□□□ 1.91
HPS1-205ENST00000414009 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.96■■□□□ 1.91
HPS1-205ENST00000414009 HMGXB3Q12766 1538 aa26.91■■□□□ 1.9
HPS1-205ENST00000414009 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HPS1-205ENST00000414009 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
HPS1-205ENST00000414009 WIZO95785 1651 aa26.83■■□□□ 1.89
HPS1-205ENST00000414009 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HPS1-205ENST00000414009 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HPS1-205ENST00000414009 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.31■■□□□ 1.8
HPS1-205ENST00000414009 NESP48681 1621 aa26.28■■□□□ 1.8
HPS1-205ENST00000414009 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.26■■□□□ 1.79
HPS1-205ENST00000414009 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.25■■□□□ 1.79
HPS1-205ENST00000414009 ERCC6Q03468 1493 aa26.23■■□□□ 1.79
HPS1-205ENST00000414009 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.16■■□□□ 1.78
HPS1-205ENST00000414009 CFTRP13569 1480 aa26.12■■□□□ 1.77
HPS1-205ENST00000414009 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.01■■□□□ 1.75
HPS1-205ENST00000414009 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
HPS1-205ENST00000414009 PRDM2Q13029 1718 aa25.98■■□□□ 1.75
HPS1-205ENST00000414009 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.97■■□□□ 1.75
HPS1-205ENST00000414009 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.94■■□□□ 1.74
HPS1-205ENST00000414009 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
HPS1-205ENST00000414009 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.85■■□□□ 1.73
HPS1-205ENST00000414009 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
HPS1-205ENST00000414009 CUX2O14529 1486 aa25.83■■□□□ 1.73
HPS1-205ENST00000414009 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.77■■□□□ 1.72
HPS1-205ENST00000414009 WDR62O43379 1518 aa25.72■■□□□ 1.71
HPS1-205ENST00000414009 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HPS1-205ENST00000414009 ABCC8Q09428 1581 aa25.64■■□□□ 1.69
HPS1-205ENST00000414009 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa25.58■■□□□ 1.69
HPS1-205ENST00000414009 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.56■■□□□ 1.68
HPS1-205ENST00000414009 TOPBP1Q92547 1522 aa25.56■■□□□ 1.68
HPS1-205ENST00000414009 CUX1P39880 1505 aa25.41■■□□□ 1.66
HPS1-205ENST00000414009 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
HPS1-205ENST00000414009 IFT140Q96RY7 1462 aa25.38■■□□□ 1.65
HPS1-205ENST00000414009 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
HPS1-205ENST00000414009 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.33■■□□□ 1.65
HPS1-205ENST00000414009 SOGA1O94964 1423 aa25.29■■□□□ 1.64
HPS1-205ENST00000414009 TOP2BQ02880 1626 aa25.27■■□□□ 1.64
HPS1-205ENST00000414009 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.26■■□□□ 1.63
HPS1-205ENST00000414009 SYNJ1O43426 1573 aa25.25■■□□□ 1.63
HPS1-205ENST00000414009 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HPS1-205ENST00000414009 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.23■■□□□ 1.63
HPS1-205ENST00000414009 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HPS1-205ENST00000414009 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HPS1-205ENST00000414009 WDR97A6NE52 1622 aa25.11■■□□□ 1.61
HPS1-205ENST00000414009 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.613e-7■■■■■ 32.1
HPS1-205ENST00000414009 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
HPS1-205ENST00000414009 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.09■■□□□ 1.61
HPS1-205ENST00000414009 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.03■■□□□ 1.6
HPS1-205ENST00000414009 GAPVD1Q14C86 1478 aa25■■□□□ 1.59
HPS1-205ENST00000414009 TRIM41Q8WV44 630 aa24.98■■□□□ 1.59
HPS1-205ENST00000414009 GRIN2BQ13224 1484 aa24.97■■□□□ 1.59
HPS1-205ENST00000414009 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.95■■□□□ 1.58
HPS1-205ENST00000414009 PBRM1Q86U86 1689 aa24.92■■□□□ 1.58
HPS1-205ENST00000414009 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
HPS1-205ENST00000414009 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.89■■□□□ 1.57
HPS1-205ENST00000414009 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
HPS1-205ENST00000414009 FBLN2P98095 1184 aa24.88■■□□□ 1.57
HPS1-205ENST00000414009 KIF27Q86VH2 1401 aa24.86■■□□□ 1.57
HPS1-205ENST00000414009 OSCARQ8IYS5 282 aa24.83■■□□□ 1.57
HPS1-205ENST00000414009 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
HPS1-205ENST00000414009 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.81■■□□□ 1.56
HPS1-205ENST00000414009 CHD1O14646 1710 aa24.78■■□□□ 1.56
HPS1-205ENST00000414009 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.78■■□□□ 1.56
HPS1-205ENST00000414009 SYNJ2O15056 1496 aa24.77■■□□□ 1.56
HPS1-205ENST00000414009 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
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