Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 BAZ2A-210ENST00000549787 2773 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -02e-6■■■□□ 14.6
G3BP1Q13283 TKT-205ENST00000460243 615 ntTSL 212.96□□□□□ -0.333e-11■■■□□ 14.6
G3BP1Q13283 EIF4G1-224ENST00000444861 2384 ntTSL 1 (best)25.55■■□□□ 1.682e-9■■■□□ 14.6
G3BP1Q13283 MYH9-206ENST00000472210 387 ntTSL 316.84■□□□□ 0.292e-11■■■□□ 14.6
G3BP1Q13283 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.196e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 TRAP1-208ENST00000573872 656 ntTSL 316.31■□□□□ 0.21e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.34e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 BUD23-206ENST00000430270 1260 ntTSL 523.02■■□□□ 1.284e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 BUD23-213ENST00000463307 1815 ntTSL 1 (best)17.54■□□□□ 0.44e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 BUD23-209ENST00000436944 2496 ntTSL 217.29■□□□□ 0.364e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.274e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 BUD23-207ENST00000430446 738 ntTSL 315.91■□□□□ 0.144e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 DHX15-201ENST00000336812 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.349e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ACY1-222ENST00000637209 687 ntTSL 522.68■■□□□ 1.224e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ACY1-223ENST00000637251 1739 ntTSL 519.59■□□□□ 0.734e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ACY1-205ENST00000469863 755 ntTSL 313.9□□□□□ -0.184e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ABHD14A-ACY1-223ENST00000637461 566 ntTSL 513.07□□□□□ -0.324e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.282e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.122e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 SLC25A1-205ENST00000470922 1598 ntTSL 228.08■■■□□ 2.092e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ERBB3-219ENST00000551242 2755 ntTSL 1 (best)14.17□□□□□ -0.143e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ERBB3-214ENST00000550070 2729 ntTSL 1 (best)12.2□□□□□ -0.463e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.713e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.923e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 NDUFS1-209ENST00000457011 2171 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.57e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 NDUFS1-202ENST00000423725 2631 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.567e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 NDUFS1-203ENST00000432169 2080 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.587e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 NDUFS1-204ENST00000440274 2394 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.927e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.097e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.197e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.37e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ERBB3-217ENST00000551085 4382 ntTSL 213.38□□□□□ -0.274e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 KRT8-210ENST00000548998 918 ntTSL 522.51■■□□□ 1.194e-9■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 217.58■□□□□ 0.412e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 MAP4-206ENST00000423088 899 ntTSL 311.1□□□□□ -0.631e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 SPTAN1-225ENST00000631121 438 ntTSL 29.44□□□□□ -0.98e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 COPB2-206ENST00000510181 1037 ntTSL 29.58□□□□□ -0.882e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 PCK2-212ENST00000560106 782 ntTSL 515.3■□□□□ 0.043e-8■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.773e-10■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ALDH7A1-210ENST00000503281 937 ntTSL 515.59■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ABHD14A-ACY1-222ENST00000637222 1048 ntTSL 523.69■■□□□ 1.386e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ACY1-216ENST00000636556 1059 ntTSL 521.82■■□□□ 1.086e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 MACF1-205ENST00000372925 14496 ntTSL 57.04□□□□□ -1.281e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 HNRNPU-227ENST00000640264 328 ntTSL 312.82□□□□□ -0.361e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 HNRNPU-208ENST00000475997 5290 ntTSL 57.15□□□□□ -1.261e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 RTCB-201ENST00000216038 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.442e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 EIF3G-206ENST00000588709 828 ntTSL 516.88■□□□□ 0.292e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 EIF3G-202ENST00000587146 709 ntTSL 516.09■□□□□ 0.172e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 EIF3G-208ENST00000589454 873 ntTSL 513.06□□□□□ -0.322e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 TARS-210ENST00000508361 2481 ntTSL 211.66□□□□□ -0.544e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 TARS-204ENST00000502553 2534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.584e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 TARS-202ENST00000455217 2523 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.674e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.734e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 TARS-212ENST00000509731 2170 ntTSL 1 (best)10.18□□□□□ -0.784e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 TARS-209ENST00000507716 2475 ntTSL 29.76□□□□□ -0.854e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 519.66■□□□□ 0.746e-10■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ATP5A1-205ENST00000586592 2214 ntTSL 228.31■■■□□ 2.122e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 22e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ATP5A1-211ENST00000590156 1931 ntTSL 217.77■□□□□ 0.442e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.262e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.232e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.432e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 ACY1-228ENST00000638096 1466 nt21.88■■□□□ 1.094e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.519e-8■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 SRSF4-208ENST00000634348 8128 ntTSL 513.43□□□□□ -0.269e-8■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.311e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.111e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.951e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.075e-7■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 TMEM214-209ENST00000460904 506 ntTSL 313.35□□□□□ -0.271e-6■■□□□ 14.5
G3BP1Q13283 PACSIN2-211ENST00000507586 362 ntTSL 37.4□□□□□ -1.224e-6■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 EIF3B-208ENST00000466199 734 ntTSL 211.34□□□□□ -0.596e-9■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 MAGED2-212ENST00000497484 990 ntTSL 218.7■□□□□ 0.581e-7■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 NARS-205ENST00000587194 562 ntTSL 415.09■□□□□ 0.013e-6■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 PSMD3-202ENST00000415039 1598 ntTSL 226.57■■□□□ 1.847e-7■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.257e-7■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 DDB1-225ENST00000545930 1278 ntTSL 212.02□□□□□ -0.499e-9■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 ENO1-202ENST00000464920 2266 ntTSL 1 (best)16.12■□□□□ 0.179e-36■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 CCT5-210ENST00000511995 1091 ntTSL 211.61□□□□□ -0.553e-8■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.177e-7■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.087e-7■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.037e-7■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 PDHA1-204ENST00000379806 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.247e-7■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 SPTAN1-220ENST00000630147 785 ntTSL 212.89□□□□□ -0.352e-8■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 EIF4G1-238ENST00000493299 559 ntTSL 414.05□□□□□ -0.161e-9■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.982e-6■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 CHD4-205ENST00000536301 107 ntTSL 36.36□□□□□ -1.398e-7■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 WDR46-234ENST00000468157 760 ntTSL 520.46■□□□□ 0.873e-6■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.323e-6■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 WDR46-236ENST00000477718 941 ntTSL 516.68■□□□□ 0.263e-6■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.212e-10■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.242e-10■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 WDR46-232ENST00000444176 968 ntTSL 512.58□□□□□ -0.43e-6■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 WDR46-237ENST00000481025 583 ntTSL 510.73□□□□□ -0.693e-6■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 NQO1-207ENST00000569118 519 ntTSL 212.65□□□□□ -0.382e-9■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 ECH1-204ENST00000595470 560 ntTSL 215.45■□□□□ 0.069e-7■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 ECH1-210ENST00000598316 553 ntTSL 214.42□□□□□ -0.19e-7■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 PRPF8-208ENST00000573716 542 ntTSL 214.95□□□□□ -0.025e-7■■□□□ 14.4
G3BP1Q13283 HSPA8-216ENST00000532167 570 ntTSL 45.5□□□□□ -1.533e-9■■□□□ 14.4
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 114.4 ms