Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.646e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 RNF4-218ENST00000513284 517 ntTSL 418.66■□□□□ 0.586e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.454e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 RNF4-201ENST00000314289 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.436e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.44e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 RNF4-212ENST00000509258 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.46e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 RNF4-222ENST00000541204 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.396e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.254e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 RNF4-221ENST00000513643 516 ntTSL 315.35■□□□□ 0.056e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CBFB-206ENST00000565389 846 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 SPAG9-219ENST00000514613 2523 ntTSL 210.13□□□□□ -0.794e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.944e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.46□□□□□ -1.066e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CBFB-208ENST00000567947 610 ntTSL 36.58□□□□□ -1.364e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.674e-8■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.864e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.471e-6■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.171e-6■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.899e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.936e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 SPRY4-AS1-202ENST00000425963 362 ntTSL 34.9□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 NCAPG2-210ENST00000491792 581 ntTSL 319.21■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 NCAPG2-207ENST00000472591 554 ntTSL 417.05■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 IL4R-206ENST00000562142 518 ntTSL 338.71■■■■□ 3.795e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 IL4R-216ENST00000566117 529 ntTSL 537.16■■■■□ 3.545e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 IL4R-217ENST00000566318 688 ntTSL 325.46■■□□□ 1.675e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 IL4R-204ENST00000561742 379 ntTSL 325.2■■□□□ 1.625e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 IL4R-211ENST00000563926 594 ntTSL 425.2■■□□□ 1.625e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 IL4R-208ENST00000563002 541 ntTSL 521.4■■□□□ 1.025e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 IL4R-209ENST00000563787 701 ntTSL 320.78■□□□□ 0.925e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 IL4R-205ENST00000561946 611 ntTSL 318.35■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 IL4R-218ENST00000568746 2900 ntTSL 217.9■□□□□ 0.465e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 IL4R-202ENST00000395762 3685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 IL4R-203ENST00000543915 3539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.091e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.991e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 TYMS-204ENST00000579128 925 ntTSL 220.12■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 PAM16-210ENST00000575636 732 ntTSL 327.89■■■□□ 2.063e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 PAM16-205ENST00000571986 606 ntTSL 327.71■■■□□ 2.033e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CORO7-PAM16-201ENST00000572274 672 ntTSL 525.44■■□□□ 1.663e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.643e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.513e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 PAM16-209ENST00000573614 650 ntTSL 523.83■■□□□ 1.413e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 PAM16-202ENST00000571178 353 ntTSL 323.46■■□□□ 1.353e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CORO7-PAM16-203ENST00000575334 3815 ntTSL 223.25■■□□□ 1.313e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.233e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 DDX10-207ENST00000534439 438 ntTSL 54.98□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 AKT2-228ENST00000537834 1402 ntTSL 227.48■■□□□ 1.993e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 AKT2-219ENST00000486368 606 ntTSL 415.51■□□□□ 0.073e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 LRRC14-203ENST00000527730 978 ntTSL 226.57■■□□□ 1.844e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.564e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.464e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.642e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CNST-204ENST00000483271 2767 ntTSL 220.46■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.782e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-206ENST00000526525 586 ntTSL 427.41■■□□□ 1.985e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 227.41■■□□□ 1.985e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-202ENST00000524751 895 ntTSL 324.44■■□□□ 1.55e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-205ENST00000526366 553 ntTSL 424.44■■□□□ 1.55e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 223.35■■□□□ 1.335e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-212ENST00000532101 1030 ntTSL 523.07■■□□□ 1.285e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.255e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 522.73■■□□□ 1.235e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-209ENST00000529802 580 ntTSL 222.39■■□□□ 1.175e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.155e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 218.44■□□□□ 0.545e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 415.12■□□□□ 0.015e-9■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 330.49■■■□□ 2.473e-6■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FNDC3A-206ENST00000541916 6328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.636e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.526e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 FNDC3A-203ENST00000484074 6082 ntTSL 1 (best)4.89□□□□□ -1.636e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 QKI-208ENST00000537041 583 ntTSL 515.75■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 QKI-216ENST00000545346 457 ntTSL 55.56□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 27.4
HNRNPMP52272 SAFB2-204ENST00000589925 506 ntTSL 326.46■■□□□ 1.831e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.455e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 POM121-204ENST00000446813 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.195e-7■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 NADK-203ENST00000342348 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 224.25■■□□□ 1.471e-6■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 AC013394.1-202ENST00000630790 4499 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-9■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.991e-6■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 STAG1-210ENST00000629124 4322 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 STAG1-207ENST00000483235 5206 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 STAG1-208ENST00000487065 2914 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 27.3
HNRNPMP52272 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.071e-6■■■■■ 27.3
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 161.3 ms