Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-213ENST00000532904 2073 ntTSL 219.12■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-216ENST00000533908 739 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.642e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.643e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.632e-20■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FAHD2A-203ENST00000445649 522 ntTSL 218.8■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.63e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FAHD2A-202ENST00000418606 715 ntTSL 318.78■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TSC2-219ENST00000563346 553 ntTSL 218.32■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ITGA5-204ENST00000547744 547 ntTSL 418.29■□□□□ 0.523e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD4-205ENST00000445776 703 ntTSL 318.07■□□□□ 0.482e-20■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 LEPROT-205ENST00000497874 377 ntTSL 1 (best)17.97■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD4-203ENST00000427779 649 ntTSL 317.92■□□□□ 0.462e-20■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.442e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-13■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FAM160B2-212ENST00000523633 627 ntTSL 217.3■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SNAP29-203ENST00000490458 972 ntTSL 217.23■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ACOX1-207ENST00000588176 574 ntTSL 417.21■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ATAD3A-205ENST00000429957 498 ntTSL 517.13■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-217ENST00000488335 379 ntTSL 317.05■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-207ENST00000526919 759 ntTSL 316.95■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-205ENST00000444256 426 ntTSL 516.81■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RNASEH2A-205ENST00000639767 647 ntTSL 516.63■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.243e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PPIF-202ENST00000448165 821 ntTSL 216.3■□□□□ 0.23e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-217ENST00000534176 943 ntTSL 316.3■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 NOL3-210ENST00000568086 578 ntTSL 416.27■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 GAK-206ENST00000504947 555 ntTSL 215.87■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SPG7-210ENST00000564409 717 ntTSL 315.82■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PKN1-213ENST00000591461 867 ntTSL 315.8■□□□□ 0.122e-11■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ACOX1-203ENST00000572047 2441 ntTSL 215.56■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPR-209ENST00000476660 1637 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.082e-16■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ACOX1-209ENST00000589301 550 ntTSL 415.51■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-209ENST00000528907 861 ntTSL 215.35■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 AGO2-203ENST00000518019 421 ntTSL 215.01□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FAM160B2-210ENST00000496599 2344 ntTSL 214.81□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-214ENST00000567440 2271 ntTSL 514.27□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-216ENST00000567974 1950 ntTSL 1 (best)13.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RAD50-209ENST00000533482 4373 ntTSL 1 (best)13.92□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 LSM8-201ENST00000249299 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.22e-13■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.233e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.252e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-207ENST00000565443 2305 ntTSL 213.46□□□□□ -0.263e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-206ENST00000564610 1876 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF621-203ENST00000403205 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.293e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FAM234A-201ENST00000301678 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-213ENST00000567263 845 ntTSL 313.01□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PSMD4-202ENST00000368884 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.332e-20■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 CISD1-201ENST00000333926 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FAM53C-207ENST00000511024 1882 ntTSL 212.58□□□□□ -0.43e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SUB1-213ENST00000515355 771 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ORC2-201ENST00000234296 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ACOX1-204ENST00000573078 2417 ntTSL 212.07□□□□□ -0.483e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-202ENST00000287196 2625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ERP29-205ENST00000553161 916 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.492e-10■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TNRC6A-205ENST00000464539 1853 ntTSL 1 (best)11.89□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ADD1-211ENST00000506157 5179 ntTSL 511.89□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ORC1-201ENST00000371566 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 USP1-204ENST00000452143 893 ntTSL 311.5□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 LEPROT-204ENST00000488747 345 ntTSL 511.49□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-201ENST00000260376 2142 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 LIG1-210ENST00000596332 584 ntTSL 211.36□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 DYNLRB1-204ENST00000480759 1053 ntTSL 311.24□□□□□ -0.612e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 NCOA3-205ENST00000497292 824 ntTSL 511.08□□□□□ -0.643e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-205ENST00000544520 2341 ntTSL 1 (best)11.04□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PARP6-203ENST00000413097 2750 ntTSL 210.94□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ZNF621-206ENST00000462161 536 ntTSL 310.73□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ACOX1-202ENST00000301608 2215 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.693e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RPA1-206ENST00000573994 844 ntTSL 210.68□□□□□ -0.73e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RTF1-204ENST00000558117 552 ntTSL 410.5□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ACOX1-211ENST00000591857 681 ntTSL 310.48□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 HEPH-208ENST00000471121 802 ntTSL 210.36□□□□□ -0.753e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ORC1-202ENST00000371568 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.763e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 CANX-210ENST00000505090 485 ntTSL 210.24□□□□□ -0.771e-14■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ANKHD1-218ENST00000506755 522 ntTSL 310.1□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TVP23C-206ENST00000521179 591 ntTSL 510.1□□□□□ -0.793e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SUB1-209ENST00000511615 1658 ntTSL 1 (best)10.08□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 MATR3-224ENST00000514488 564 ntTSL 49.89□□□□□ -0.832e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TVP23C-209ENST00000583206 701 ntTSL 59.87□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 37.3
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3654.2 ms