Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 RNF220-207ENST00000470498 594 ntTSL 34.49□□□□□ -1.693e-10■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 TPRN-203ENST00000477345 3350 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.281e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 DLGAP4-214ENST00000491207 469 ntTSL 413.59□□□□□ -0.233e-13■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 RNF220-201ENST00000335497 1203 ntTSL 524.75■■□□□ 1.553e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 RNF220-205ENST00000440132 1200 ntTSL 218.48■□□□□ 0.553e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 RNF220-206ENST00000453863 361 ntTSL 38.73□□□□□ -1.013e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.131e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 C16orf58-210ENST00000568491 2422 ntTSL 215.91■□□□□ 0.141e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 MCRIP1-209ENST00000575090 752 ntTSL 321.46■■□□□ 1.033e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 AP5Z1-206ENST00000491375 786 ntTSL 520.39■□□□□ 0.855e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 GAS8-208ENST00000564789 810 ntTSL 218.77■□□□□ 0.61e-12■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.528e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 GAS8-204ENST00000540721 1308 ntTSL 218.31■□□□□ 0.521e-12■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 AP5Z1-207ENST00000496303 5660 ntTSL 217.6■□□□□ 0.415e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 PPIF-204ENST00000492149 646 ntTSL 216.29■□□□□ 0.28e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 PPIF-205ENST00000498681 518 ntTSL 216.01■□□□□ 0.158e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 PPIF-203ENST00000472580 761 ntTSL 516.01■□□□□ 0.158e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.148e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.138e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.035e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 PPIF-202ENST00000448165 821 ntTSL 214.79□□□□□ -0.048e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 AP5Z1-204ENST00000477680 3081 ntTSL 214.39□□□□□ -0.115e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.221e-12■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.321e-12■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 GAS8-214ENST00000566266 3174 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.691e-12■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 GAS8-219ENST00000569558 3856 ntTSL 210.5□□□□□ -0.731e-12■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.611e-8■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 SLC16A3-216ENST00000583025 955 ntTSL 218.32■□□□□ 0.525e-8■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.081e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.61e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -01e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.311e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 SLC1A5-204ENST00000593713 774 ntTSL 310.52□□□□□ -0.731e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 EFNA1-204ENST00000474413 1083 ntTSL 317■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 EFNA1-203ENST00000469878 1288 ntTSL 312.78□□□□□ -0.362e-7■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.761e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 22.8
PRPF4O43172 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.182e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 LMF1-204ENST00000562226 1088 ntTSL 219.66■□□□□ 0.742e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.652e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 LMF1-213ENST00000568964 853 ntTSL 218.27■□□□□ 0.522e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.452e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 LMF1-210ENST00000567595 663 ntTSL 317.15■□□□□ 0.342e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 LMF1-203ENST00000545827 2731 ntTSL 217.01■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 LMF1-215ENST00000570014 882 ntTSL 515.74■□□□□ 0.112e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 LMF1-209ENST00000566627 694 ntTSL 315.29■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 RPH3AL-217ENST00000575634 571 ntTSL 414.28□□□□□ -0.124e-10■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 LMF1-205ENST00000562380 551 ntTSL 44.02□□□□□ -1.772e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 HPCAL1-205ENST00000423674 586 ntTSL 421.77■■□□□ 1.085e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.995e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.25e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.125e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.385e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 MTA2-203ENST00000526844 627 ntTSL 38.73□□□□□ -1.015e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.425e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.385e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.528e-8■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.018e-8■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 UBB-206ENST00000577958 376 ntTSL 214.61□□□□□ -0.078e-8■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 512.19□□□□□ -0.468e-8■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 UBB-205ENST00000577640 724 ntTSL 59.95□□□□□ -0.828e-8■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.028e-8■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 26e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.976e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.936e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PQLC1-206ENST00000474967 2319 ntTSL 520.95■□□□□ 0.946e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PQLC1-201ENST00000351365 2414 ntTSL 219.54■□□□□ 0.726e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 LAMA5-207ENST00000471042 487 ntTSL 213.5□□□□□ -0.254e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.473e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.373e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.133e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 AKIRIN1-204ENST00000531822 718 ntTSL 58.47□□□□□ -1.053e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PFKL-205ENST00000466134 5986 ntTSL 221.35■■□□□ 1.012e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.482e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PFKL-202ENST00000397961 3390 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.032e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 DCUN1D2-211ENST00000496873 499 ntTSL 320.63■□□□□ 0.894e-18■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 DCUN1D2-206ENST00000465710 460 ntTSL 312.29□□□□□ -0.444e-18■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 DCUN1D2-204ENST00000439909 562 ntTSL 58.88□□□□□ -0.994e-18■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 ASPSCR1-214ENST00000582404 534 ntTSL 316.46■□□□□ 0.234e-8■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.876e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 SLC25A39-213ENST00000591006 2217 ntTSL 213.9□□□□□ -0.184e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -02e-6■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PTOV1-208ENST00000597730 327 ntTSL 214.65□□□□□ -0.062e-7■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.631e-6■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.431e-6■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.891e-6■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.381e-6■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.218e-17■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.654e-6■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 KLHL14-202ENST00000359358 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.734e-6■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 ARL6IP4-219ENST00000542099 1119 ntTSL 322.22■■□□□ 1.156e-10■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.776e-10■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.056e-10■■■■□ 22.7
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