RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567595.1

LMF1-210, Transcript of lipase maturation factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene LMF1, Length 663 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1-210ENST00000567595 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.3■■■■■ 4.68
LMF1-210ENST00000567595 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.51■■■■□ 3.92
LMF1-210ENST00000567595 ABCC9O60706 1549 aa38.76■■■■□ 3.8
LMF1-210ENST00000567595 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.26■■■■□ 3.56
LMF1-210ENST00000567595 NACADO15069 1562 aa37.2■■■■□ 3.55
LMF1-210ENST00000567595 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.97■■■■□ 3.51
LMF1-210ENST00000567595 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.92■■■■□ 3.5
LMF1-210ENST00000567595 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
LMF1-210ENST00000567595 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.72■■■■□ 3.47
LMF1-210ENST00000567595 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.39■■■■□ 3.42
LMF1-210ENST00000567595 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.16■■■■□ 3.38
LMF1-210ENST00000567595 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
LMF1-210ENST00000567595 SCRIBQ14160 1630 aa35.93■■■■□ 3.34
LMF1-210ENST00000567595 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.84■■■■□ 3.33
LMF1-210ENST00000567595 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.8■■■■□ 3.32
LMF1-210ENST00000567595 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
LMF1-210ENST00000567595 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.1■■■■□ 3.21
LMF1-210ENST00000567595 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.89■■■■□ 3.18
LMF1-210ENST00000567595 SMARCA4P51532 1647 aa34.41■■■■□ 3.1
LMF1-210ENST00000567595 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
LMF1-210ENST00000567595 NCAPD3P42695 1498 aa34.33■■■■□ 3.09
LMF1-210ENST00000567595 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.29■■■■□ 3.08
LMF1-210ENST00000567595 SMARCA2P51531 1590 aa34.24■■■■□ 3.07
LMF1-210ENST00000567595 HMGXB3Q12766 1538 aa34.14■■■■□ 3.06
LMF1-210ENST00000567595 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.14■■■■□ 3.06
LMF1-210ENST00000567595 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.11■■■■□ 3.05
LMF1-210ENST00000567595 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
LMF1-210ENST00000567595 WIZO95785 1651 aa33.7■■■□□ 2.99
LMF1-210ENST00000567595 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
LMF1-210ENST00000567595 NESP48681 1621 aa33.49■■■□□ 2.95
LMF1-210ENST00000567595 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.45■■■□□ 2.95
LMF1-210ENST00000567595 ERCC6Q03468 1493 aa33.43■■■□□ 2.94
LMF1-210ENST00000567595 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
LMF1-210ENST00000567595 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.29■■■□□ 2.92
LMF1-210ENST00000567595 CUX2O14529 1486 aa33.25■■■□□ 2.91
LMF1-210ENST00000567595 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.21■■■□□ 2.91
LMF1-210ENST00000567595 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.1■■■□□ 2.89
LMF1-210ENST00000567595 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
LMF1-210ENST00000567595 CFTRP13569 1480 aa33.06■■■□□ 2.88
LMF1-210ENST00000567595 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.97■■■□□ 2.87
LMF1-210ENST00000567595 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.88■■■□□ 2.85
LMF1-210ENST00000567595 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.87■■■□□ 2.85
LMF1-210ENST00000567595 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.86■■■□□ 2.85
LMF1-210ENST00000567595 WDR62O43379 1518 aa32.8■■■□□ 2.84
LMF1-210ENST00000567595 PRDM2Q13029 1718 aa32.78■■■□□ 2.84
LMF1-210ENST00000567595 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
LMF1-210ENST00000567595 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
LMF1-210ENST00000567595 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.45■■■□□ 2.79
LMF1-210ENST00000567595 ABCC8Q09428 1581 aa32.37■■■□□ 2.77
LMF1-210ENST00000567595 TOPBP1Q92547 1522 aa32.35■■■□□ 2.77
LMF1-210ENST00000567595 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.3■■■□□ 2.76
LMF1-210ENST00000567595 IFT140Q96RY7 1462 aa32.21■■■□□ 2.75
LMF1-210ENST00000567595 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
LMF1-210ENST00000567595 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
LMF1-210ENST00000567595 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
LMF1-210ENST00000567595 CUX1P39880 1505 aa32.01■■■□□ 2.72
LMF1-210ENST00000567595 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.92■■■□□ 2.7
LMF1-210ENST00000567595 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.92■■■□□ 2.7
LMF1-210ENST00000567595 SOGA1O94964 1423 aa31.9■■■□□ 2.7
LMF1-210ENST00000567595 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.88■■■□□ 2.69
LMF1-210ENST00000567595 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.83■■■□□ 2.69
LMF1-210ENST00000567595 WDR97A6NE52 1622 aa31.82■■■□□ 2.68
LMF1-210ENST00000567595 OSCARQ8IYS5 282 aa31.77■■■□□ 2.68
LMF1-210ENST00000567595 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
LMF1-210ENST00000567595 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.72■■■□□ 2.673e-6■■■■■ 66.3
LMF1-210ENST00000567595 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.71■■■□□ 2.67
LMF1-210ENST00000567595 TOP2BQ02880 1626 aa31.7■■■□□ 2.66
LMF1-210ENST00000567595 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.65■■■□□ 2.66
LMF1-210ENST00000567595 SYNJ1O43426 1573 aa31.64■■■□□ 2.66
LMF1-210ENST00000567595 GRIN2BQ13224 1484 aa31.58■■■□□ 2.65
LMF1-210ENST00000567595 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.54■■■□□ 2.64
LMF1-210ENST00000567595 CHD1O14646 1710 aa31.54■■■□□ 2.64
LMF1-210ENST00000567595 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.53■■■□□ 2.64
LMF1-210ENST00000567595 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.53■■■□□ 2.64
LMF1-210ENST00000567595 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
LMF1-210ENST00000567595 PBRM1Q86U86 1689 aa31.48■■■□□ 2.63
LMF1-210ENST00000567595 FBLN2P98095 1184 aa31.41■■■□□ 2.62
LMF1-210ENST00000567595 SYNJ2O15056 1496 aa31.4■■■□□ 2.62
LMF1-210ENST00000567595 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
LMF1-210ENST00000567595 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.29■■■□□ 2.6
LMF1-210ENST00000567595 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.29■■■□□ 2.6
LMF1-210ENST00000567595 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.29■■■□□ 2.6
LMF1-210ENST00000567595 ARHGEF11O15085 1522 aa31.28■■■□□ 2.6
LMF1-210ENST00000567595 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.27■■■□□ 2.6
LMF1-210ENST00000567595 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.25■■■□□ 2.59
LMF1-210ENST00000567595 ADAMTS12P58397 1594 aa31.24■■■□□ 2.59
LMF1-210ENST00000567595 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.18■■■□□ 2.58
LMF1-210ENST00000567595 GRIN2AQ12879 1464 aa31.17■■■□□ 2.58
LMF1-210ENST00000567595 TRIM41Q8WV44 630 aa31.17■■■□□ 2.58
LMF1-210ENST00000567595 NUP160Q12769 1436 aa31.07■■■□□ 2.57
LMF1-210ENST00000567595 KIF27Q86VH2 1401 aa31.07■■■□□ 2.57
LMF1-210ENST00000567595 CEP170Q5SW79 1584 aa31.01■■■□□ 2.56
LMF1-210ENST00000567595 ARAP1Q96P48 1450 aa31.01■■■□□ 2.55
LMF1-210ENST00000567595 IGF1RP08069 1367 aa31■■■□□ 2.55
LMF1-210ENST00000567595 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.93■■■□□ 2.54
LMF1-210ENST00000567595 CUL7Q14999 1698 aa30.93■■■□□ 2.54
LMF1-210ENST00000567595 SHROOM2Q13796 1616 aa30.87■■■□□ 2.53
LMF1-210ENST00000567595 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.79■■■□□ 2.52
LMF1-210ENST00000567595 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.78■■■□□ 2.52
LMF1-210ENST00000567595 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.75■■■□□ 2.51
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