Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 CAPN12-205ENST00000595177 488 ntTSL 414.28□□□□□ -0.123e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 CSK-208ENST00000567123 556 ntTSL 413.96□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 CAPN12-202ENST00000593700 1118 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.373e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.423e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 EIF2D-205ENST00000468891 542 ntTSL 312.28□□□□□ -0.445e-11■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SPTB-206ENST00000553938 3456 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.463e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 FOS-207ENST00000555672 834 ntTSL 212.16□□□□□ -0.463e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 DEAF1-205ENST00000526790 498 ntTSL 212.15□□□□□ -0.463e-6■□□□□ 10.1
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SF3B4Q15427 MON1B-207ENST00000566455 2864 ntTSL 212.06□□□□□ -0.483e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 CSK-203ENST00000562066 533 ntTSL 411.94□□□□□ -0.53e-6■□□□□ 10.1
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SF3B4Q15427 CAPN12-204ENST00000594552 1046 ntTSL 211.92□□□□□ -0.53e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 BDP1-204ENST00000508917 7194 ntTSL 1 (best)11.9□□□□□ -0.53e-6■□□□□ 10.1
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SF3B4Q15427 R3HDM2-203ENST00000393811 3778 ntTSL 1 (best)11.57□□□□□ -0.563e-6■□□□□ 10.1
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SF3B4Q15427 WASL-201ENST00000223023 4435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 R3HDM2-205ENST00000403821 3347 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.663e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 CAPN12-209ENST00000597987 896 ntTSL 510.84□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 10.1
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SF3B4Q15427 R3HDM2-202ENST00000358907 3974 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.763e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SCNM1-202ENST00000368905 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 10.1
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SF3B4Q15427 SCNM1-206ENST00000497147 862 ntTSL 28.8□□□□□ -13e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 R3HDM2-210ENST00000547019 595 ntTSL 38.77□□□□□ -1.013e-6■□□□□ 10.1
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SF3B4Q15427 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.673e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.713e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.733e-6■□□□□ 10.1
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SF3B4Q15427 ACAP2-202ENST00000423531 475 ntTSL 53.53□□□□□ -1.843e-6■□□□□ 10.1
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SF3B4Q15427 DNAJB4-203ENST00000476396 673 ntTSL 33.5□□□□□ -1.853e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 POU2F1-210ENST00000490100 508 ntTSL 22.78□□□□□ -1.963e-6■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 OPA1-211ENST00000434811 554 ntTSL 42.76□□□□□ -1.974e-8■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SMOX-211ENST00000494098 812 ntTSL 59.05□□□□□ -0.965e-9■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SARAF-205ENST00000518340 582 ntTSL 316.82■□□□□ 0.282e-14■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SARAF-203ENST00000518174 1981 ntTSL 516.6■□□□□ 0.252e-14■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.222e-14■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SARAF-206ENST00000520303 1803 ntTSL 1 (best)15.73■□□□□ 0.112e-14■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-14■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SARAF-208ENST00000521265 1741 ntTSL 512.14□□□□□ -0.472e-14■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 SARAF-212ENST00000523127 735 ntTSL 54.46□□□□□ -1.72e-14■□□□□ 10.1
SF3B4Q15427 PDLIM7-212ENST00000504380 556 ntTSL 211.84□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 10
SF3B4Q15427 LPCAT4-202ENST00000562404 577 ntTSL 39.98□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 10
SF3B4Q15427 PUM1-213ENST00000524516 561 ntTSL 27.46□□□□□ -1.226e-7■□□□□ 10
SF3B4Q15427 PUM1-209ENST00000480602 906 ntTSL 56.7□□□□□ -1.346e-7■□□□□ 10
SF3B4Q15427 MAPK12-208ENST00000496942 2763 ntTSL 218.11■□□□□ 0.493e-7■□□□□ 10
SF3B4Q15427 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.516e-14■□□□□ 10
SF3B4Q15427 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.376e-14■□□□□ 10
SF3B4Q15427 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.466e-14■□□□□ 10
SF3B4Q15427 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.576e-14■□□□□ 10
SF3B4Q15427 CLINT1-209ENST00000530302 668 ntTSL 26.54□□□□□ -1.366e-14■□□□□ 10
SF3B4Q15427 CLINT1-202ENST00000518855 3394 ntTSL 25□□□□□ -1.616e-14■□□□□ 10
SF3B4Q15427 CLINT1-204ENST00000521615 399 ntTSL 34.94□□□□□ -1.626e-14■□□□□ 10
SF3B4Q15427 MIB2-218ENST00000505370 809 ntTSL 221.78■■□□□ 1.086e-8■□□□□ 10
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