RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567123.1

CSK-208, Transcript of C-terminal Src kinase, human

TSL 4

Gene CSK, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSK-208	ENST00000567123	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		38.92	■■■■□ 3.82
CSK-208	ENST00000567123	ABCC9	O60706	1549 aa		35.59	■■■■□ 3.29
CSK-208	ENST00000567123	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.09	■■■■□ 3.21
CSK-208	ENST00000567123	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.76	■■■□□ 2.99
CSK-208	ENST00000567123	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.64	■■■□□ 2.98
CSK-208	ENST00000567123	NACAD	O15069	1562 aa		33.29	■■■□□ 2.92
CSK-208	ENST00000567123	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.06	■■■□□ 2.88
CSK-208	ENST00000567123	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CSK-208	ENST00000567123	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CSK-208	ENST00000567123	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CSK-208	ENST00000567123	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CSK-208	ENST00000567123	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.19	■■■□□ 2.74
CSK-208	ENST00000567123	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
CSK-208	ENST00000567123	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CSK-208	ENST00000567123	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.1	■■■□□ 2.73
CSK-208	ENST00000567123	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.09	■■■□□ 2.73
CSK-208	ENST00000567123	SCRIB	Q14160	1630 aa		32	■■■□□ 2.71
CSK-208	ENST00000567123	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
CSK-208	ENST00000567123	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		31.3	■■■□□ 2.6
CSK-208	ENST00000567123	CUX2	O14529	1486 aa		30.82	■■■□□ 2.53
CSK-208	ENST00000567123	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.76	■■■□□ 2.51
CSK-208	ENST00000567123	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.75	■■■□□ 2.51
CSK-208	ENST00000567123	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.61	■■■□□ 2.49
CSK-208	ENST00000567123	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.49	■■■□□ 2.47
CSK-208	ENST00000567123	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.48	■■■□□ 2.47
CSK-208	ENST00000567123	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.46	■■■□□ 2.47
CSK-208	ENST00000567123	NES	P48681	1621 aa		30.44	■■■□□ 2.46
CSK-208	ENST00000567123	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.3	■■■□□ 2.44
CSK-208	ENST00000567123	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.24	■■■□□ 2.43
CSK-208	ENST00000567123	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.22	■■■□□ 2.43
CSK-208	ENST00000567123	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.15	■■■□□ 2.42
CSK-208	ENST00000567123	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.11	■■■□□ 2.41
CSK-208	ENST00000567123	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30	■■■□□ 2.39
CSK-208	ENST00000567123	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.99	■■■□□ 2.39
CSK-208	ENST00000567123	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.96	■■■□□ 2.39
CSK-208	ENST00000567123	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.8	■■■□□ 2.36
CSK-208	ENST00000567123	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CSK-208	ENST00000567123	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CSK-208	ENST00000567123	WDR62	O43379	1518 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CSK-208	ENST00000567123	WIZ	O95785	1651 aa		29.59	■■■□□ 2.33
CSK-208	ENST00000567123	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.55	■■■□□ 2.32
CSK-208	ENST00000567123	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.48	■■■□□ 2.31
CSK-208	ENST00000567123	CFTR	P13569	1480 aa		29.37	■■■□□ 2.29
CSK-208	ENST00000567123	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CSK-208	ENST00000567123	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
CSK-208	ENST00000567123	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
CSK-208	ENST00000567123	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	29.2	■■■□□ 2.27
CSK-208	ENST00000567123	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CSK-208	ENST00000567123	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CSK-208	ENST00000567123	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CSK-208	ENST00000567123	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
CSK-208	ENST00000567123	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.97	■■■□□ 2.23
CSK-208	ENST00000567123	PRDM2	Q13029	1718 aa		28.96	■■■□□ 2.23
CSK-208	ENST00000567123	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.89	■■■□□ 2.22
CSK-208	ENST00000567123	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CSK-208	ENST00000567123	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CSK-208	ENST00000567123	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
CSK-208	ENST00000567123	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CSK-208	ENST00000567123	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CSK-208	ENST00000567123	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CSK-208	ENST00000567123	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.66	■■■□□ 2.18	7e-6	■■■□□ 17.6
CSK-208	ENST00000567123	CHD1	O14646	1710 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CSK-208	ENST00000567123	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CSK-208	ENST00000567123	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CSK-208	ENST00000567123	FBLN2	P98095	1184 aa		28.56	■■■□□ 2.16
CSK-208	ENST00000567123	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
CSK-208	ENST00000567123	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.53	■■■□□ 2.16
CSK-208	ENST00000567123	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.46	■■■□□ 2.15
CSK-208	ENST00000567123	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
CSK-208	ENST00000567123	SOGA1	O94964	1423 aa		28.39	■■■□□ 2.14
CSK-208	ENST00000567123	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.38	■■■□□ 2.13
CSK-208	ENST00000567123	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.33	■■■□□ 2.13
CSK-208	ENST00000567123	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.32	■■■□□ 2.12
CSK-208	ENST00000567123	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.29	■■■□□ 2.12
CSK-208	ENST00000567123	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.26	■■■□□ 2.11
CSK-208	ENST00000567123	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
CSK-208	ENST00000567123	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
CSK-208	ENST00000567123	CUX1	P39880	1505 aa		28.22	■■■□□ 2.11
CSK-208	ENST00000567123	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.21	■■■□□ 2.11
CSK-208	ENST00000567123	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.17	■■■□□ 2.1
CSK-208	ENST00000567123	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.06	■■■□□ 2.08
CSK-208	ENST00000567123	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.03	■■■□□ 2.08
CSK-208	ENST00000567123	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
CSK-208	ENST00000567123	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CSK-208	ENST00000567123	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		27.95	■■■□□ 2.06
CSK-208	ENST00000567123	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.87	■■■□□ 2.05
CSK-208	ENST00000567123	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.85	■■■□□ 2.05
CSK-208	ENST00000567123	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.8	■■■□□ 2.04
CSK-208	ENST00000567123	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CSK-208	ENST00000567123	NUP160	Q12769	1436 aa		27.78	■■■□□ 2.04
CSK-208	ENST00000567123	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	27.74	■■■□□ 2.03
CSK-208	ENST00000567123	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.68	■■■□□ 2.02
CSK-208	ENST00000567123	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.67	■■■□□ 2.02
CSK-208	ENST00000567123	TOP2B	Q02880	1626 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CSK-208	ENST00000567123	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		27.61	■■■□□ 2.01
CSK-208	ENST00000567123	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CSK-208	ENST00000567123	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.57	■■■□□ 2
CSK-208	ENST00000567123	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
CSK-208	ENST00000567123	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		27.52	■■■□□ 2
CSK-208	ENST00000567123	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.45	■■□□□ 1.98

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