Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 43
UTP3Q9NQZ2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.919e-7■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 RHOT2-222ENST00000569675 2559 ntTSL 219.81■□□□□ 0.769e-7■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.964e-9■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 ASPM-203ENST00000367409 10887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.714e-9■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.438e-7■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 ATP2A2-207ENST00000548169 2951 ntTSL 210.74□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 313.83□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 KIF2C-204ENST00000452259 1124 ntTSL 59.11□□□□□ -0.958e-7■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 KIF2C-208ENST00000493027 1091 ntTSL 57.8□□□□□ -1.168e-7■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-225ENST00000553064 1786 ntTSL 514.61□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-210ENST00000547859 1919 ntTSL 211.92□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 PCBP2-218ENST00000550585 2543 ntTSL 510.03□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 SAMD4B-212ENST00000602243 672 ntTSL 326.12■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 42.9
UTP3Q9NQZ2 UBAC1-206ENST00000489050 864 ntTSL 310□□□□□ -0.812e-9■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 HMG20B-206ENST00000453933 759 ntTSL 222.96■■□□□ 1.271e-6■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 HMG20B-204ENST00000417382 561 ntTSL 422.41■■□□□ 1.181e-6■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 HNRNPUL1-212ENST00000599521 336 ntTSL 210.93□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 CIRBP-209ENST00000586555 716 ntTSL 221.91■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 CIRBP-220ENST00000588917 1087 ntTSL 220.91■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 CIRBP-245ENST00000621399 1044 ntTSL 1 (best)19.93■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 CIRBP-227ENST00000590188 361 ntTSL 319.3■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 CIRBP-203ENST00000444172 584 ntTSL 319.27■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 DDX17-204ENST00000431312 1853 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.154e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.361e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 TRIT1-209ENST00000486825 850 ntTSL 516.52■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.094e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 TRIT1-205ENST00000462797 2000 ntTSL 513.8□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 TRIT1-201ENST00000316891 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.214e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 TRIT1-212ENST00000492612 983 ntTSL 513□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 TRIT1-215ENST00000541099 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 TRIT1-213ENST00000495175 1156 ntTSL 1 (best)11.93□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 TRIT1-211ENST00000491865 738 ntTSL 510.9□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 TRIT1-203ENST00000441669 1851 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 TRIT1-210ENST00000489945 861 ntTSL 58.86□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 NAP1L4-203ENST00000430811 860 ntTSL 227.12■■□□□ 1.938e-8■■■■■ 42.8
UTP3Q9NQZ2 DNPH1-204ENST00000509253 834 ntTSL 332.14■■■□□ 2.741e-7■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.411e-7■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.91e-7■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 TGFBR1-207ENST00000549766 1678 ntTSL 526.47■■□□□ 1.833e-9■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.077e-7■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM164-206ENST00000464177 761 ntTSL 513.92□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 ARID4A-201ENST00000348476 5562 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.317e-7■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.73e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.533e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 GDF15-203ENST00000595973 890 ntTSL 520.02■□□□□ 0.83e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 GDF15-202ENST00000594925 294 ntTSL 316.44■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 C17orf99-205ENST00000586999 379 ntTSL 215.3■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 C17orf99-206ENST00000591995 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 414.52□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.61□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 C17orf99-201ENST00000340363 984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 42.7
UTP3Q9NQZ2 EYA3-206ENST00000471498 1806 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC5.53□□□□□ -1.522e-30■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 LMNB1-203ENST00000460265 3475 ntTSL 1 (best)17■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.473e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF10B-207ENST00000523504 1464 ntTSL 223.36■■□□□ 1.333e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.215e-7■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF10B-201ENST00000276431 4146 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 ELOVL6-205ENST00000506625 610 ntTSL 410.51□□□□□ -0.735e-7■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 ELOVL6-204ENST00000506461 575 ntTSL 49.1□□□□□ -0.955e-7■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 TNFRSF10B-208ENST00000523752 3328 ntTSL 1 (best)8.69□□□□□ -1.023e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.265e-7■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 ELOVL6-208ENST00000514184 607 ntTSL 36.5□□□□□ -1.375e-7■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 ELOVL6-203ENST00000503885 458 ntTSL 45.4□□□□□ -1.545e-7■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 POLR2L-202ENST00000534030 585 ntTSL 420.43■□□□□ 0.861e-10■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-206ENST00000423081 590 ntTSL 316.33■□□□□ 0.21e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-10■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 TANK-223ENST00000494976 636 ntTSL 313.98□□□□□ -0.171e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-202ENST00000368962 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.211e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-211ENST00000487584 558 ntTSL 413.51□□□□□ -0.251e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-207ENST00000448029 668 ntTSL 513.23□□□□□ -0.291e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-217ENST00000534805 2043 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.31e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-203ENST00000368963 1045 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 DDRGK1-204ENST00000496781 865 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.571e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-208ENST00000459773 791 ntTSL 310.55□□□□□ -0.721e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 TANK-216ENST00000461338 674 ntTSL 39.53□□□□□ -0.881e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 TANK-221ENST00000483622 566 ntTSL 58.86□□□□□ -0.991e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-213ENST00000498193 3854 ntTSL 28.69□□□□□ -1.021e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.141e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-209ENST00000463774 570 ntTSL 47.9□□□□□ -1.141e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-201ENST00000271640 4437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.151e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 TANK-220ENST00000477952 427 ntTSL 27.21□□□□□ -1.261e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-204ENST00000368964 548 ntTSL 56.9□□□□□ -1.31e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 SETDB1-214ENST00000525956 587 ntTSL 45.65□□□□□ -1.51e-9■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 DCAF6-208ENST00000470721 2803 ntTSL 218.72■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 42.6
UTP3Q9NQZ2 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 42.6
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