RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586555.2

CIRBP-209, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene CIRBP, Length 716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-209ENST00000586555 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.57■■■■■ 5.69
CIRBP-209ENST00000586555 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.28■■■■■ 4.84
CIRBP-209ENST00000586555 ABCC9O60706 1549 aa45.08■■■■■ 4.81
CIRBP-209ENST00000586555 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.01■■■■■ 4.48
CIRBP-209ENST00000586555 NACADO15069 1562 aa42.79■■■■■ 4.44
CIRBP-209ENST00000586555 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.51■■■■■ 4.4
CIRBP-209ENST00000586555 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.31■■■■■ 4.36
CIRBP-209ENST00000586555 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.26■■■■■ 4.36
CIRBP-209ENST00000586555 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.08■■■■■ 4.33
CIRBP-209ENST00000586555 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.02■■■■■ 4.321e-14■■□□□ 14.3
CIRBP-209ENST00000586555 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
CIRBP-209ENST00000586555 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.82■■■■■ 4.29
CIRBP-209ENST00000586555 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.8■■■■■ 4.28
CIRBP-209ENST00000586555 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.25■■■■■ 4.19
CIRBP-209ENST00000586555 SCRIBQ14160 1630 aa41.21■■■■■ 4.19
CIRBP-209ENST00000586555 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.77■■■■■ 4.12
CIRBP-209ENST00000586555 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.73■■■■■ 4.11
CIRBP-209ENST00000586555 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.62■■■■■ 4.09
CIRBP-209ENST00000586555 NCAPD3P42695 1498 aa39.54■■■■□ 3.92
CIRBP-209ENST00000586555 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.41■■■■□ 3.9
CIRBP-209ENST00000586555 SMARCA4P51532 1647 aa39.38■■■■□ 3.89
CIRBP-209ENST00000586555 SMARCA2P51531 1590 aa39.28■■■■□ 3.88
CIRBP-209ENST00000586555 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.21■■■■□ 3.87
CIRBP-209ENST00000586555 HMGXB3Q12766 1538 aa39.21■■■■□ 3.87
CIRBP-209ENST00000586555 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.06■■■■□ 3.84
CIRBP-209ENST00000586555 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.98■■■■□ 3.83
CIRBP-209ENST00000586555 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.95■■■■□ 3.83
CIRBP-209ENST00000586555 ERCC6Q03468 1493 aa38.88■■■■□ 3.81
CIRBP-209ENST00000586555 CUX2O14529 1486 aa38.83■■■■□ 3.81
CIRBP-209ENST00000586555 NESP48681 1621 aa38.8■■■■□ 3.8
CIRBP-209ENST00000586555 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.68■■■■□ 3.78
CIRBP-209ENST00000586555 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.57■■■■□ 3.77
CIRBP-209ENST00000586555 WIZO95785 1651 aa38.47■■■■□ 3.75
CIRBP-209ENST00000586555 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.38■■■■□ 3.73
CIRBP-209ENST00000586555 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.34■■■■□ 3.73
CIRBP-209ENST00000586555 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.31■■■■□ 3.72
CIRBP-209ENST00000586555 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.3■■■■□ 3.72
CIRBP-209ENST00000586555 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.22■■■■□ 3.71
CIRBP-209ENST00000586555 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38■■■■□ 3.67
CIRBP-209ENST00000586555 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.98■■■■□ 3.67
CIRBP-209ENST00000586555 CFTRP13569 1480 aa37.92■■■■□ 3.66
CIRBP-209ENST00000586555 WDR62O43379 1518 aa37.91■■■■□ 3.66
CIRBP-209ENST00000586555 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.84■■■■□ 3.65
CIRBP-209ENST00000586555 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.84■■■■□ 3.65
CIRBP-209ENST00000586555 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.59■■■■□ 3.61
CIRBP-209ENST00000586555 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.54■■■■□ 3.6
CIRBP-209ENST00000586555 PRDM2Q13029 1718 aa37.52■■■■□ 3.6
CIRBP-209ENST00000586555 TOPBP1Q92547 1522 aa37.16■■■■□ 3.54
CIRBP-209ENST00000586555 IFT140Q96RY7 1462 aa37.13■■■■□ 3.53
CIRBP-209ENST00000586555 ABCC8Q09428 1581 aa37.11■■■■□ 3.53
CIRBP-209ENST00000586555 OSCARQ8IYS5 282 aa37.1■■■■□ 3.53
CIRBP-209ENST00000586555 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.08■■■■□ 3.53
CIRBP-209ENST00000586555 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
CIRBP-209ENST00000586555 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.02■■■■□ 3.52
CIRBP-209ENST00000586555 TRIM41Q8WV44 630 aa36.93■■■■□ 3.5
CIRBP-209ENST00000586555 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
CIRBP-209ENST00000586555 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
CIRBP-209ENST00000586555 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.79■■■■□ 3.48
CIRBP-209ENST00000586555 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.73■■■■□ 3.472e-18■■■■□ 24
CIRBP-209ENST00000586555 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.65■■■■□ 3.46
CIRBP-209ENST00000586555 SOGA1O94964 1423 aa36.63■■■■□ 3.45
CIRBP-209ENST00000586555 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.57■■■■□ 3.44
CIRBP-209ENST00000586555 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.57■■■■□ 3.44
CIRBP-209ENST00000586555 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.57■■■■□ 3.44
CIRBP-209ENST00000586555 CUX1P39880 1505 aa36.57■■■■□ 3.44
CIRBP-209ENST00000586555 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.56■■■■□ 3.44
CIRBP-209ENST00000586555 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
CIRBP-209ENST00000586555 CHD1O14646 1710 aa36.52■■■■□ 3.44
CIRBP-209ENST00000586555 WDR97A6NE52 1622 aa36.48■■■■□ 3.43
CIRBP-209ENST00000586555 ARHGEF11O15085 1522 aa36.47■■■■□ 3.43
CIRBP-209ENST00000586555 FBLN2P98095 1184 aa36.39■■■■□ 3.42
CIRBP-209ENST00000586555 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.33■■■■□ 3.41
CIRBP-209ENST00000586555 GRIN2BQ13224 1484 aa36.29■■■■□ 3.4
CIRBP-209ENST00000586555 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
CIRBP-209ENST00000586555 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
CIRBP-209ENST00000586555 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.19■■■■□ 3.38
CIRBP-209ENST00000586555 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.19■■■■□ 3.38
CIRBP-209ENST00000586555 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.18■■■■□ 3.38
CIRBP-209ENST00000586555 SYNJ2O15056 1496 aa36.15■■■■□ 3.38
CIRBP-209ENST00000586555 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.13■■■■□ 3.38
CIRBP-209ENST00000586555 ARAP1Q96P48 1450 aa36.13■■■■□ 3.37
CIRBP-209ENST00000586555 PBRM1Q86U86 1689 aa36.13■■■■□ 3.37
CIRBP-209ENST00000586555 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.11■■■■□ 3.37
CIRBP-209ENST00000586555 SYNJ1O43426 1573 aa36.1■■■■□ 3.37
CIRBP-209ENST00000586555 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.36
CIRBP-209ENST00000586555 TOP2BQ02880 1626 aa36.04■■■■□ 3.36
CIRBP-209ENST00000586555 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.04■■■■□ 3.36
CIRBP-209ENST00000586555 GRIN2AQ12879 1464 aa35.81■■■■□ 3.32
CIRBP-209ENST00000586555 ADAMTS12P58397 1594 aa35.8■■■■□ 3.32
CIRBP-209ENST00000586555 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.74■■■■□ 3.31
CIRBP-209ENST00000586555 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.73■■■■□ 3.31
CIRBP-209ENST00000586555 NUP160Q12769 1436 aa35.72■■■■□ 3.31
CIRBP-209ENST00000586555 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
CIRBP-209ENST00000586555 CEP170Q5SW79 1584 aa35.68■■■■□ 3.3
CIRBP-209ENST00000586555 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.57■■■■□ 3.28
CIRBP-209ENST00000586555 SHROOM2Q13796 1616 aa35.54■■■■□ 3.28
CIRBP-209ENST00000586555 JPH4Q96JJ6 628 aa35.36■■■■□ 3.25
CIRBP-209ENST00000586555 IGF1RP08069 1367 aa35.36■■■■□ 3.25
CIRBP-209ENST00000586555 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
CIRBP-209ENST00000586555 KIF27Q86VH2 1401 aa35.32■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms