Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 ARL6IP1-205ENST00000563861 948 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.288e-8■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 NDUFS3-202ENST00000524568 733 ntTSL 224.12■■□□□ 1.452e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 OTUB1-204ENST00000447683 2315 ntTSL 219.75■□□□□ 0.752e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 OTUB1-207ENST00000536443 553 ntTSL 312.21□□□□□ -0.452e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 KHK-206ENST00000490823 1396 ntTSL 523.92■■□□□ 1.424e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.694e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.534e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 EFTUD2-221ENST00000591856 366 ntTSL 310.06□□□□□ -0.82e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 CCT3-212ENST00000478640 583 ntTSL 214□□□□□ -0.177e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 TRIM28-209ENST00000597423 733 ntTSL 318.89■□□□□ 0.614e-10■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 NOC2L-204ENST00000483767 1611 ntTSL 223.23■■□□□ 1.312e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 SPTAN1-218ENST00000629137 479 ntTSL 211.45□□□□□ -0.588e-10■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ATIC-213ENST00000479093 772 ntTSL 26.15□□□□□ -1.424e-9■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.66e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.766e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.871e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.821e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.36e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.756e-6■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.157e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.37e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PUM1-215ENST00000525948 1103 ntTSL 312.44□□□□□ -0.427e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.697e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.87e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.867e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 58.94□□□□□ -0.987e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PUM1-209ENST00000480602 906 ntTSL 58.69□□□□□ -1.027e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.087e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PUM1-218ENST00000526215 586 ntTSL 27.89□□□□□ -1.157e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.187e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.258e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 28.98□□□□□ -0.978e-7■■■□□ 14.9
G3BP1Q13283 ATIC-208ENST00000444305 569 ntTSL 419.22■□□□□ 0.675e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 ATIC-214ENST00000488712 744 ntTSL 312.7□□□□□ -0.385e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 COPB2-213ENST00000515006 548 ntTSL 57.38□□□□□ -1.233e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.721e-8■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.661e-8■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 HNRNPF-207ENST00000544000 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.021e-8■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.021e-8■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-8■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 HNRNPK-208ENST00000481820 957 ntTSL 26.98□□□□□ -1.291e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 HNRNPK-210ENST00000492865 528 ntTSL 24.78□□□□□ -1.641e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.814e-8■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.144e-8■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 PSMD11-205ENST00000493026 2387 ntTSL 215.18■□□□□ 0.021e-6■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.579e-9■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.289e-9■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 AKAP1-203ENST00000481416 4089 ntTSL 512.09□□□□□ -0.479e-9■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 QARS-214ENST00000478561 670 ntTSL 319.57■□□□□ 0.722e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 LARP1-211ENST00000521577 817 ntTSL 530.53■■■□□ 2.481e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 LARP1-213ENST00000523163 843 ntTSL 59.81□□□□□ -0.841e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 SPTAN1-205ENST00000472211 272 ntTSL 315.58■□□□□ 0.081e-8■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.972e-6■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 CREB3L2-205ENST00000458726 776 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.572e-6■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 CREB3L2-202ENST00000420629 719 ntTSL 37.37□□□□□ -1.232e-6■■■□□ 14.8
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G3BP1Q13283 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.756e-6■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.391e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 SNTB1-203ENST00000519177 1962 ntTSL 1 (best)22.78■■□□□ 1.241e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.11e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.583e-15■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.243e-15■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.133e-15■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.063e-15■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.153e-15■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.293e-15■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 DDX18-204ENST00000474694 1083 ntTSL 510.17□□□□□ -0.782e-6■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.892e-6■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.662e-6■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.883e-7■■■□□ 14.8
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G3BP1Q13283 MARS-204ENST00000545888 2979 ntTSL 517.52■□□□□ 0.45e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.135e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 MARS-203ENST00000537638 3592 ntTSL 215.38■□□□□ 0.055e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.781e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 TUBA1C-203ENST00000548470 1105 ntTSL 214.43□□□□□ -0.11e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 TUBA1C-209ENST00000552448 1800 ntTSL 313.06□□□□□ -0.321e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 TUBA1C-202ENST00000541364 1695 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.471e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 TUBA1C-210ENST00000639419 1075 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 DDB1-205ENST00000535174 896 ntTSL 320.76■□□□□ 0.911e-8■■■□□ 14.8
G3BP1Q13283 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.463e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.653e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 CCT8-210ENST00000496121 1326 ntTSL 210.3□□□□□ -0.762e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.523e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 DNAJA1-203ENST00000495015 604 ntTSL 39.67□□□□□ -0.863e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 DDX24-210ENST00000622786 1730 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.714e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.673e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.593e-7■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 KDM1A-205ENST00000494920 905 ntTSL 313.66□□□□□ -0.225e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-216ENST00000641856 2619 nt21.11■□□□□ 0.972e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.942e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.742e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-208ENST00000585320 503 ntTSL 318.97■□□□□ 0.632e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-212ENST00000641427 1411 nt17.13■□□□□ 0.332e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-215ENST00000641709 3232 nt16.85■□□□□ 0.292e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-203ENST00000582171 1372 ntTSL 216.51■□□□□ 0.232e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.032e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-214ENST00000641703 1131 nt15□□□□□ -0.012e-6■■■□□ 14.7
G3BP1Q13283 PNPO-210ENST00000641305 3315 nt14.89□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 14.7
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