Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EFHD1Q9BUP0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFHD1Q9BUP0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms