Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
EFHD1Q9BUP0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EFHD1Q9BUP0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
EFHD1Q9BUP0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
EFHD1Q9BUP0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EFHD1Q9BUP0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EFHD1Q9BUP0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
EFHD1Q9BUP0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EFHD1Q9BUP0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
EFHD1Q9BUP0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
EFHD1Q9BUP0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
EFHD1Q9BUP0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
EFHD1Q9BUP0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EFHD1Q9BUP0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
EFHD1Q9BUP0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
EFHD1Q9BUP0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
EFHD1Q9BUP0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
EFHD1Q9BUP0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
EFHD1Q9BUP0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
EFHD1Q9BUP0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
EFHD1Q9BUP0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
EFHD1Q9BUP0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EFHD1Q9BUP0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EFHD1Q9BUP0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EFHD1Q9BUP0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EFHD1Q9BUP0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
EFHD1Q9BUP0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EFHD1Q9BUP0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EFHD1Q9BUP0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EFHD1Q9BUP0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EFHD1Q9BUP0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EFHD1Q9BUP0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
EFHD1Q9BUP0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
EFHD1Q9BUP0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
EFHD1Q9BUP0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
EFHD1Q9BUP0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
EFHD1Q9BUP0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EFHD1Q9BUP0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
EFHD1Q9BUP0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EFHD1Q9BUP0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
EFHD1Q9BUP0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EFHD1Q9BUP0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EFHD1Q9BUP0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EFHD1Q9BUP0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EFHD1Q9BUP0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFHD1Q9BUP0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFHD1Q9BUP0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFHD1Q9BUP0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EFHD1Q9BUP0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFHD1Q9BUP0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
EFHD1Q9BUP0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EFHD1Q9BUP0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EFHD1Q9BUP0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
EFHD1Q9BUP0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EFHD1Q9BUP0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EFHD1Q9BUP0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EFHD1Q9BUP0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EFHD1Q9BUP0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
EFHD1Q9BUP0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EFHD1Q9BUP0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EFHD1Q9BUP0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EFHD1Q9BUP0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EFHD1Q9BUP0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFHD1Q9BUP0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EFHD1Q9BUP0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EFHD1Q9BUP0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EFHD1Q9BUP0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFHD1Q9BUP0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFHD1Q9BUP0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFHD1Q9BUP0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EFHD1Q9BUP0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EFHD1Q9BUP0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EFHD1Q9BUP0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EFHD1Q9BUP0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EFHD1Q9BUP0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFHD1Q9BUP0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EFHD1Q9BUP0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EFHD1Q9BUP0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EFHD1Q9BUP0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EFHD1Q9BUP0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EFHD1Q9BUP0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EFHD1Q9BUP0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EFHD1Q9BUP0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EFHD1Q9BUP0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFHD1Q9BUP0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EFHD1Q9BUP0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFHD1Q9BUP0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EFHD1Q9BUP0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EFHD1Q9BUP0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EFHD1Q9BUP0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EFHD1Q9BUP0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EFHD1Q9BUP0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EFHD1Q9BUP0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EFHD1Q9BUP0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFHD1Q9BUP0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EFHD1Q9BUP0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EFHD1Q9BUP0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EFHD1Q9BUP0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EFHD1Q9BUP0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EFHD1Q9BUP0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms