Protein–RNA interactions for Protein: P51812

RPS6KA3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA3P51812 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS6KA3P51812 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RPS6KA3P51812 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms