RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429762.7

VSX1-205, Transcript of visual system homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VSX1, Length 1,977 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1-205ENST00000429762 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.13■■■■■ 5.62
VSX1-205ENST00000429762 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.65■■■■■ 4.58
VSX1-205ENST00000429762 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.1■■■■■ 4.33
VSX1-205ENST00000429762 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.63■■■■■ 4.25
VSX1-205ENST00000429762 ABCC9O60706 1549 aa41.53■■■■■ 4.24
VSX1-205ENST00000429762 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.3■■■■■ 4.2
VSX1-205ENST00000429762 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.16■■■■■ 4.18
VSX1-205ENST00000429762 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.77■■■■■ 4.12
VSX1-205ENST00000429762 NACADO15069 1562 aa40.65■■■■■ 4.1
VSX1-205ENST00000429762 SCRIBQ14160 1630 aa40.36■■■■■ 4.05
VSX1-205ENST00000429762 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.36■■■■■ 4.05
VSX1-205ENST00000429762 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.69■■■■□ 3.94
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VSX1-205ENST00000429762 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.21■■■■□ 3.87
VSX1-205ENST00000429762 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.08■■■■□ 3.85
VSX1-205ENST00000429762 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
VSX1-205ENST00000429762 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.82■■■■□ 3.81
VSX1-205ENST00000429762 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
VSX1-205ENST00000429762 SMARCA4P51532 1647 aa38.58■■■■□ 3.77
VSX1-205ENST00000429762 WIZO95785 1651 aa38.55■■■■□ 3.76
VSX1-205ENST00000429762 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
VSX1-205ENST00000429762 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
VSX1-205ENST00000429762 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.99■■■■□ 3.67
VSX1-205ENST00000429762 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.94■■■■□ 3.66
VSX1-205ENST00000429762 SMARCA2P51531 1590 aa37.84■■■■□ 3.65
VSX1-205ENST00000429762 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.73■■■■□ 3.63
VSX1-205ENST00000429762 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.71■■■■□ 3.63
VSX1-205ENST00000429762 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.69■■■■□ 3.62
VSX1-205ENST00000429762 NCAPD3P42695 1498 aa37.53■■■■□ 3.6
VSX1-205ENST00000429762 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.52■■■■□ 3.6
VSX1-205ENST00000429762 HMGXB3Q12766 1538 aa37.48■■■■□ 3.59
VSX1-205ENST00000429762 TRIM41Q8WV44 630 aa37.04■■■■□ 3.52
VSX1-205ENST00000429762 ABCC8Q09428 1581 aa37■■■■□ 3.51
VSX1-205ENST00000429762 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.76■■■■□ 3.48
VSX1-205ENST00000429762 CFTRP13569 1480 aa36.72■■■■□ 3.47
VSX1-205ENST00000429762 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.62■■■■□ 3.45
VSX1-205ENST00000429762 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.62■■■■□ 3.45
VSX1-205ENST00000429762 PRDM2Q13029 1718 aa36.56■■■■□ 3.44
VSX1-205ENST00000429762 SYNJ1O43426 1573 aa36.56■■■■□ 3.44
VSX1-205ENST00000429762 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
VSX1-205ENST00000429762 NESP48681 1621 aa36.48■■■■□ 3.43
VSX1-205ENST00000429762 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.4■■■■□ 3.42
VSX1-205ENST00000429762 TOP2BQ02880 1626 aa36.31■■■■□ 3.4
VSX1-205ENST00000429762 CUX1P39880 1505 aa36.29■■■■□ 3.4
VSX1-205ENST00000429762 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.28■■■■□ 3.4
VSX1-205ENST00000429762 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.27■■■■□ 3.4
VSX1-205ENST00000429762 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.27■■■■□ 3.4
VSX1-205ENST00000429762 SOGA1O94964 1423 aa36.26■■■■□ 3.39
VSX1-205ENST00000429762 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.17■■■■□ 3.38
VSX1-205ENST00000429762 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.17■■■■□ 3.38
VSX1-205ENST00000429762 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.02■■■■□ 3.36
VSX1-205ENST00000429762 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36■■■■□ 3.35
VSX1-205ENST00000429762 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36■■■■□ 3.35
VSX1-205ENST00000429762 EEA1Q15075 1411 aa35.95■■■■□ 3.34
VSX1-205ENST00000429762 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.9■■■■□ 3.34
VSX1-205ENST00000429762 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.89■■■■□ 3.34
VSX1-205ENST00000429762 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.88■■■■□ 3.33
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VSX1-205ENST00000429762 KIF27Q86VH2 1401 aa35.66■■■■□ 3.3
VSX1-205ENST00000429762 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.59■■■■□ 3.29
VSX1-205ENST00000429762 KIF21BO75037 1637 aa35.59■■■■□ 3.29
VSX1-205ENST00000429762 GOLGA3Q08378 1498 aa35.57■■■■□ 3.29
VSX1-205ENST00000429762 ERCC6Q03468 1493 aa35.55■■■■□ 3.28
VSX1-205ENST00000429762 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
VSX1-205ENST00000429762 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.5■■■■□ 3.27
VSX1-205ENST00000429762 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.49■■■■□ 3.27
VSX1-205ENST00000429762 WDR97A6NE52 1622 aa35.44■■■■□ 3.26
VSX1-205ENST00000429762 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.42■■■■□ 3.26
VSX1-205ENST00000429762 PRXQ9BXM0 1461 aa35.42■■■■□ 3.26
VSX1-205ENST00000429762 WDR62O43379 1518 aa35.39■■■■□ 3.26
VSX1-205ENST00000429762 IGF1RP08069 1367 aa35.38■■■■□ 3.25
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VSX1-205ENST00000429762 CEP162Q5TB80 1403 aa35.32■■■■□ 3.24
VSX1-205ENST00000429762 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.32■■■■□ 3.24
VSX1-205ENST00000429762 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
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VSX1-205ENST00000429762 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.2■■■■□ 3.23
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VSX1-205ENST00000429762 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.09■■■■□ 3.21
VSX1-205ENST00000429762 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
VSX1-205ENST00000429762 CUL7Q14999 1698 aa35.07■■■■□ 3.2
VSX1-205ENST00000429762 CLIP1P30622 1438 aa35.04■■■■□ 3.2
VSX1-205ENST00000429762 PBRM1Q86U86 1689 aa35.04■■■■□ 3.2
VSX1-205ENST00000429762 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
VSX1-205ENST00000429762 GRIN2BQ13224 1484 aa34.87■■■■□ 3.17
VSX1-205ENST00000429762 ADAMTS12P58397 1594 aa34.82■■■■□ 3.16
VSX1-205ENST00000429762 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP34.82■■■■□ 3.16
VSX1-205ENST00000429762 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.76■■■■□ 3.15
VSX1-205ENST00000429762 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.75■■■■□ 3.15
VSX1-205ENST00000429762 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.74■■■■□ 3.15
VSX1-205ENST00000429762 ARAP1Q96P48 1450 aa34.74■■■■□ 3.15
VSX1-205ENST00000429762 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.71■■■■□ 3.15
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