Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 29.34□□□□□ -0.913e-6■■■□□ 14.9
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NIPBLQ6KC79 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-9■■■□□ 14.9
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NIPBLQ6KC79 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.483e-6■■□□□ 14.5
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NIPBLQ6KC79 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-8■■□□□ 14.5
NIPBLQ6KC79 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-8■■□□□ 14.5
NIPBLQ6KC79 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.321e-8■■□□□ 14.5
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