RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448947.2

C6orf223-204, Transcript of chromosome 6 open reading frame 223, humanhuman

TSL 3

Gene C6orf223, Length 869 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf223-204ENST00000448947 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.37■■■■■ 7.26
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C6orf223-204ENST00000448947 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.13■■■■■ 5.61
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C6orf223-204ENST00000448947 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.02■■■■■ 5.6
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C6orf223-204ENST00000448947 SCRIBQ14160 1630 aa48.87■■■■■ 5.41
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C6orf223-204ENST00000448947 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.02■■■■■ 5.12
C6orf223-204ENST00000448947 CECR2Q9BXF3 1484 aa47■■■■■ 5.11
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C6orf223-204ENST00000448947 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.33■■■■■ 5.01
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C6orf223-204ENST00000448947 NESP48681 1621 aa45.08■■■■■ 4.81
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C6orf223-204ENST00000448947 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.93■■■■■ 4.78
C6orf223-204ENST00000448947 CFTRP13569 1480 aa44.78■■■■■ 4.76
C6orf223-204ENST00000448947 ERCC6Q03468 1493 aa44.66■■■■■ 4.74
C6orf223-204ENST00000448947 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.63■■■■■ 4.73
C6orf223-204ENST00000448947 PRDM2Q13029 1718 aa44.63■■■■■ 4.73
C6orf223-204ENST00000448947 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.62■■■■■ 4.73
C6orf223-204ENST00000448947 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.44■■■■■ 4.7
C6orf223-204ENST00000448947 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
C6orf223-204ENST00000448947 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.34■■■■■ 4.69
C6orf223-204ENST00000448947 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.19■■■■■ 4.66
C6orf223-204ENST00000448947 WDR62O43379 1518 aa44.08■■■■■ 4.65
C6orf223-204ENST00000448947 CUX2O14529 1486 aa44.06■■■■■ 4.64
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C6orf223-204ENST00000448947 TOPBP1Q92547 1522 aa43.8■■■■■ 4.6
C6orf223-204ENST00000448947 ABCC8Q09428 1581 aa43.76■■■■■ 4.6
C6orf223-204ENST00000448947 CUX1P39880 1505 aa43.66■■■■■ 4.58
C6orf223-204ENST00000448947 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.47■■■■■ 4.55
C6orf223-204ENST00000448947 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
C6orf223-204ENST00000448947 SYNJ1O43426 1573 aa43.43■■■■■ 4.54
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C6orf223-204ENST00000448947 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.41■■■■■ 4.54
C6orf223-204ENST00000448947 TOP2BQ02880 1626 aa43.4■■■■■ 4.54
C6orf223-204ENST00000448947 IFT140Q96RY7 1462 aa43.38■■■■■ 4.54
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C6orf223-204ENST00000448947 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.25■■■■■ 4.51
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C6orf223-204ENST00000448947 WDR97A6NE52 1622 aa43.14■■■■■ 4.5
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C6orf223-204ENST00000448947 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.01■■■■■ 4.48
C6orf223-204ENST00000448947 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.97■■■■■ 4.47
C6orf223-204ENST00000448947 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
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C6orf223-204ENST00000448947 PBRM1Q86U86 1689 aa42.76■■■■■ 4.44
C6orf223-204ENST00000448947 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.76■■■■■ 4.44
C6orf223-204ENST00000448947 GRIN2BQ13224 1484 aa42.68■■■■■ 4.42
C6orf223-204ENST00000448947 TRIM41Q8WV44 630 aa42.66■■■■■ 4.42
C6orf223-204ENST00000448947 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.61■■■■■ 4.41
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C6orf223-204ENST00000448947 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.51■■■■■ 4.39
C6orf223-204ENST00000448947 CHD1O14646 1710 aa42.5■■■■■ 4.39
C6orf223-204ENST00000448947 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.48■■■■■ 4.39
C6orf223-204ENST00000448947 ADAMTS12P58397 1594 aa42.41■■■■■ 4.38
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C6orf223-204ENST00000448947 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.34■■■■■ 4.37
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C6orf223-204ENST00000448947 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.27■■■■■ 4.36
C6orf223-204ENST00000448947 OSCARQ8IYS5 282 aa42.24■■■■■ 4.35
C6orf223-204ENST00000448947 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
C6orf223-204ENST00000448947 CUL7Q14999 1698 aa42.23■■■■■ 4.35
C6orf223-204ENST00000448947 GRIN2AQ12879 1464 aa42.17■■■■■ 4.34
C6orf223-204ENST00000448947 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.15■■■■■ 4.34
C6orf223-204ENST00000448947 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.03■■■■■ 4.32
C6orf223-204ENST00000448947 CLASP1Q7Z460 1538 aa42■■■■■ 4.31
C6orf223-204ENST00000448947 CEP170Q5SW79 1584 aa41.99■■■■■ 4.31
C6orf223-204ENST00000448947 NUP160Q12769 1436 aa41.97■■■■■ 4.31
C6orf223-204ENST00000448947 EEA1Q15075 1411 aa41.97■■■■■ 4.31
C6orf223-204ENST00000448947 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.86■■■■■ 4.29
C6orf223-204ENST00000448947 PRXQ9BXM0 1461 aa41.85■■■■■ 4.29
C6orf223-204ENST00000448947 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.83■■■■■ 4.29
C6orf223-204ENST00000448947 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
C6orf223-204ENST00000448947 SHROOM2Q13796 1616 aa41.67■■■■■ 4.26
C6orf223-204ENST00000448947 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.66■■■■■ 4.26
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