Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IRF8Q02556 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IRF8Q02556 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms