Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CXCL3P19876 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXCL3P19876 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms