Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC6Q9Y625 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPC6Q9Y625 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC6Q9Y625 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC6Q9Y625 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPC6Q9Y625 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPC6Q9Y625 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GPC6Q9Y625 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC6Q9Y625 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPC6Q9Y625 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC6Q9Y625 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC6Q9Y625 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC6Q9Y625 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPC6Q9Y625 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC6Q9Y625 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GPC6Q9Y625 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPC6Q9Y625 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC6Q9Y625 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC6Q9Y625 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPC6Q9Y625 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC6Q9Y625 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC6Q9Y625 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC6Q9Y625 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPC6Q9Y625 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GPC6Q9Y625 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC6Q9Y625 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPC6Q9Y625 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPC6Q9Y625 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC6Q9Y625 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPC6Q9Y625 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC6Q9Y625 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC6Q9Y625 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPC6Q9Y625 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPC6Q9Y625 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPC6Q9Y625 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPC6Q9Y625 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPC6Q9Y625 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPC6Q9Y625 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC6Q9Y625 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC6Q9Y625 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPC6Q9Y625 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC6Q9Y625 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC6Q9Y625 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC6Q9Y625 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC6Q9Y625 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GPC6Q9Y625 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms