Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E8

PCDHB15, Protocadherin beta-15, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB15Q9Y5E8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PCDHB15Q9Y5E8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PCDHB15Q9Y5E8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PCDHB15Q9Y5E8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCDHB15Q9Y5E8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCDHB15Q9Y5E8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCDHB15Q9Y5E8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCDHB15Q9Y5E8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PCDHB15Q9Y5E8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PCDHB15Q9Y5E8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
PCDHB15Q9Y5E8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
PCDHB15Q9Y5E8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PCDHB15Q9Y5E8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
PCDHB15Q9Y5E8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCDHB15Q9Y5E8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PCDHB15Q9Y5E8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PCDHB15Q9Y5E8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PCDHB15Q9Y5E8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PCDHB15Q9Y5E8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCDHB15Q9Y5E8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCDHB15Q9Y5E8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCDHB15Q9Y5E8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PCDHB15Q9Y5E8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCDHB15Q9Y5E8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCDHB15Q9Y5E8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PCDHB15Q9Y5E8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCDHB15Q9Y5E8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCDHB15Q9Y5E8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCDHB15Q9Y5E8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCDHB15Q9Y5E8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PCDHB15Q9Y5E8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PCDHB15Q9Y5E8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PCDHB15Q9Y5E8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PCDHB15Q9Y5E8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PCDHB15Q9Y5E8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PCDHB15Q9Y5E8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PCDHB15Q9Y5E8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PCDHB15Q9Y5E8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PCDHB15Q9Y5E8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PCDHB15Q9Y5E8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PCDHB15Q9Y5E8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PCDHB15Q9Y5E8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PCDHB15Q9Y5E8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.77■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PCDHB15Q9Y5E8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PCDHB15Q9Y5E8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PCDHB15Q9Y5E8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCDHB15Q9Y5E8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PCDHB15Q9Y5E8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PCDHB15Q9Y5E8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms